卵巢囊肿分为生理性囊肿和病理性囊肿，比较常见的是黄体囊肿、滤泡囊肿等。黄体囊肿是由于排卵后形成黄体，没有及时吸收而形成囊肿。盆腔炎导致输卵管卵巢脓肿，导致囊肿的发生。病理性囊肿比较常见的是上皮性肿瘤、生殖细胞肿瘤、卵巢性索间质肿瘤、转移的肿瘤。以上皮性肿瘤为代表，发病原因认为是卵巢浆液性肿瘤，大多起源于输卵管的病变，导致卵巢肿瘤的发生。上皮性肿瘤可能跟遗传因素也有关系，比如家族性卵巢癌和乳腺癌的患者会有遗传因素，子宫内膜异位症恶变会导致卵巢子宫内膜样肿瘤或者透明细胞癌，持续排卵会导致卵巢上皮不断的损伤和修复，可能会增加卵巢肿瘤的发生。
微创卵巢囊肿术后建议休息一个月。因为从腹部皮肤来看，在单孔或者是三孔腹腔镜下做的手术损伤似乎是非常小，可是盆腔里边做手术的步骤跟开腹做手术的步骤基本是一样的，所以要给予休息一个月左右的时间身体才能够完全康复，并且在休息期间饮食上要加强营养，多吃含蛋白质的食物。患者也要注意多吃新鲜的水果和蔬菜，这样增加机体抵抗力后可使身体尽快康复。
有卵巢囊肿的患者需要做肿瘤标志物的检查，因为虽然卵巢囊肿在临床上绝大部分都是良性肿瘤，但是个别的可能会发生恶性变，为了给临床提供更好的诊断依据，也可以初步决定究竟采取哪种术式来切除囊肿。所以建议做肿瘤标志物的化验检查。一旦有阳性结果，就建议结合临床病史尽快考虑手术给予治疗；并且在术中可以做冰冻病理切片，然后可以决定手术范围。
卵巢囊肿如果非常大的情况下，出现压迫症状，压迫到坐骨神经的时候就会引起大腿根部的疼痛，常常在手术之后，这种疼痛的症状就会明显的缓解。建议患者可以健侧卧位睡觉，减轻相应的压迫症状，并且建议尽快的做手术给予治疗。卵巢囊肿在临床上虽然绝大部分是良性的，但是个别也可能会发生恶性变，尤其是对比较大的囊肿，要引起重视，尽早切除病灶并且送病理化验。
卵巢囊肿依据性质分为良性、交界性和恶性三种，良性的卵巢囊肿表现为表面比较光滑、边界比较清楚、体积可大可小。如果体积在4cm以下，医学上定期观察无需手术处理。如果直径在5cm以上，并且三个月持续存在，建议尽早做腹腔镜手术，剔除囊肿保留卵巢功能。卵巢囊肿在B超下显示的是表面不光滑、形状不规则，内部可见乳头样改变，可能是交界性或者恶性的肿物，要通过检测血中肿瘤标记物的水平综合判断。卵巢囊肿最后性质的判断是依靠切除的囊肿送病理检查作为诊断的金标准，体积超过5cm并且三个月持续存在，应该积极的手术治疗。
卵巢囊肿手术之后可能会在短时间内对月经造成影响，因为在做手术过程中对卵巢局部会造成刺激，而卵巢是性腺组织会周期性的分泌雌激素和孕激才使子宫内膜脱落，在临床上表现为月经。所以一旦卵巢受到相应影响的时候，就会对月经造成影响。随着时间的推移，这种影响会逐渐消失，性激素恢复到正常状态，所以月经也会恢复正常。
巧克力卵巢囊肿是子宫内膜异位症。是由于子宫内膜异位到卵巢的位置而形成的囊肿。在子宫腔内内膜剥脱后颜色是暗红色的，类似巧克力，所以在卵巢上发生的又叫巧克力卵巢囊肿。一般发生巧克力卵巢囊肿是双侧，在月经期会出现两侧的下腹疼痛，也就是痛经的表现。如果巧克力卵巢囊肿较小，疼痛较轻也可以给予适当的止痛来缓解；如果巧克力卵巢囊肿较大，担心发生蒂扭转的情况，也可以采用微创手术，但是术后一般容易复发。
卵巢囊肿会导致不孕。因为患有卵巢囊肿的病人，多数会出现月经失调，以及卵巢不能周期性排卵或者是卵巢丧失排卵的能力，那么就会导致不孕的发生。如果患有的卵巢囊肿较小，不影响正常的月经，卵巢也会周期性的排卵，那么一般就不会影响怀孕。所以当患有卵巢囊肿，又想生育，应该去医院检查，根据医生的指导，来做相应的处理。
卵巢囊肿行腹腔镜下手术的费用，不同级别的医院收费是不同的。如果是二级医院，腹腔镜下卵巢囊肿手术，如果按病种收费，则需要七千二百元左右，除去报销后，个人自费二千五百元左右。如果是三级医院，按病种收费，则需要八千元左右，除去报销，个人则自费三千五百元左右。如果是在乡镇医院，除去报销，则只要自费八百元左右。
卵巢囊肿多数为卵巢良性肿瘤。卵巢囊肿往往没有症状，常常在妇科检查时偶然发现。肿瘤增大时，患者会感觉腹胀或者患者自己扪及肿块。如果卵巢囊肿巨大，患者可以出现尿频，便秘等压迫症状。卵巢囊肿还可以出现蒂扭转，患者会在体位改变时，突然出现一侧下腹痛，甚至伴有恶心呕吐等症。部分患者卵巢囊肿蒂扭转可以自然复位，随后腹痛缓解。
卵巢囊肿绝大部分是妇科的良性肿瘤，那么到目前为止病因还不清楚，但是如果是卵巢巧克力囊肿，主要是由于子宫内膜异位症所引起的。如果临床上已经诊断为病理性卵巢囊肿，那么建议尽快手术治疗，可以在月经干净3-7天去医院做白带化验，如果没有炎症的情况下就住院准备手术，并且将切除的囊肿送病理化验，根据病理诊断，临床再决定下一步是否需要进一步治疗。
卵巢囊肿腹腔镜手术，一般需要住院4-5天。入院第1天，要晨起空腹做术前准备。检查血液分析，尿液分析，肝功能测定，肾功能测定，乙肝五项，丙型肝炎，梅毒，人免疫缺陷病毒，血凝，心电，胸透等。如无手术禁忌症，一般入选后第2日，行腹腔镜手术。术后抗炎治疗。通常抗炎48小时。术后第3天，切口换药后，患者就可以出院了。
卵巢囊肿。可分为生理性的囊肿和病理性的囊肿。卵巢是一个内分泌器官，生理性的囊肿一般与月经周期有关，一般无需特殊处理，定期观察即可。病理性的囊肿主要是与家族性遗传因素，内分泌代谢的紊乱，某些基因位点的突变有关。若病理性囊肿体积比较大，压迫周围的正常组织器官，且引起明显的临床症状如腹痛，则要及时行手术医疗。
卵巢囊肿6cm是比较严重的，建议尽快手术治疗，在手术之前可以做妇科肿瘤，三项的化验排除恶性肿瘤的可能性。另外，术前建议检查白带常规。如果有阴道炎症，暂时先治疗阴道炎症，治愈后才可以手术。切除的组织物一定送病理化验，临床上根据病理结果，再决定是否需要进一步的治疗，如果是卵巢巧可力囊肿临床上常常有痛经的病史，建议术后给予达菲林治疗。
卵巢囊肿2cm不需特殊处理，建议动态观察，至少下次月经干净后再次复查子宫附件彩超，有一部分囊肿可自行消失，这种囊肿为生理性囊肿，如增大的卵泡或黄体囊肿。如复查子宫附件彩超后发现囊肿较前增大，且生长迅速，大于5cm，查肿瘤标志物高于正常，建议手术治疗。如囊肿持续存在，且增长缓慢，肿瘤标志物正常，可口服红金消结胶囊类散结类中成药半个月，下一个月经周期复查，了解囊肿情况。
当卵巢囊肿较小时，可以怀孩子的，如果卵巢囊肿比较大，影响了卵巢排卵，或者是不排卵，那就不容易怀孕，甚至不能怀孕，所以需要在怀孕之前先做个治疗。只要有正常卵巢，有正常的生殖和内分泌功能，成熟的卵子排到盆腔里，输卵管没有阻塞，精子能通过子宫腔到达输卵管壶腹部，与卵子结合，发育成受精卵，就不会影响怀孕的。
卵巢囊肿大部分为卵巢上生长的良性肿瘤，早期肿瘤较小时没有症状。肿瘤增至中等大时可感觉到腹胀或者是腹部扪及肿块。若肿瘤长大，充满盆腹腔，会出现压迫症状像尿频，便秘，气急，心悸等不适。有的影响卵巢排卵，导致不孕。有的出现卵巢肿瘤蒂扭转，导致卵巢缺血坏死。约3%的卵巢肿瘤会发生破裂，导致腹腔内出血，腹膜炎及休克。少部分卵巢囊肿会引起感染，较少的卵巢囊肿可发生恶变。
卵巢囊肿如果比较小的时候，基本上没有症状，常常是在妇科检查的时候偶然发现，如果囊肿体积比较大，可能会感觉腹胀，或者在腹部摸到肿块。另外，如果肿瘤出现压迫症状，还可能会出现尿频，便秘。如果做B超，会发现单侧一个囊性包块，表面光滑。卵巢囊肿的表现和性质有关系，如果是巧克力囊肿，有的还可能会出现，进行性加重的痛经症状。
子宫囊肿和卵巢囊肿是完全不一样，首先囊肿生长的位置不同，子宫囊肿是指宫颈上的纳氏囊肿，所以囊肿是在宫颈上形成，而卵巢囊肿是指卵巢上有异常的液性暗区出现。同时引起囊肿的原因也会有很大差异，导致子宫囊肿的原因，是新生的鳞状上皮在替代柱状上皮的过程中，将宫颈腺管覆盖或者堵塞，导致腺管内的液体淤积而形成囊肿。而卵巢囊肿可能是由于高水平的雌激素刺激导致，也有可能是子宫内膜异位形成。
卵巢肿瘤来源于卵巢表面的生发上皮，生发上皮来自原始体腔上皮，具有分化为各种苗勒上皮的潜能。向输卵管上皮分化形成浆液性肿瘤，向宫颈黏膜分化形成黏液性肿瘤，向子宫内膜分化形成子宫内膜样肿瘤。卵巢上皮性肿瘤分为良性，交界性和恶性。交界性肿瘤是一种低度恶性潜能肿瘤，上皮细胞增生活跃，细胞层次增加，核异型及核分裂象增加，常无间质浸润。