间充质干细胞，又称多潜能基质细胞，简称MSCs,是属于中胚层的一类多能干细胞，主要存在于结缔组织和器官间质中，包括：骨髓、胎盘、脐带、脂 肪、粘膜、骨骼、肌肉、肺、肝、胰腺等组织以及羊水、羊膜、脐带血等。在适宜条件下可分化为脂肪、骨、软骨等多种组织细胞。1976 年，Freidenstein首次发现在骨髓里存在一群贴壁生长细胞，形态和成纤维细胞相似，呈克隆性增殖，命名为骨髓间充质干细胞。后研究发现间充质干 细胞来源于发育早期的中胚层和外胚层，属于多能干细胞，广泛存在于人体的许多种组织中，具有多向分化潜能、造血支持和促进干细胞植入、免疫调控和自我复制 等潜能。
间充质干细胞的基本特性包括：
（1）强大的增殖能力和多向分化潜能：在适宜的体内或体外环境下分化为成骨细胞、软骨细胞、脂肪细胞、肌细胞、神经细胞、肝细胞、内皮细胞、基质细胞等多种细胞的能力。
（2）免疫调节功能：通过细胞间的相互作用及产生细胞因子干扰树突状细胞功能并抑制T细胞的增殖及其免疫反应，从而发挥免疫重建的功能。
（3）来源多样、取材方便，易于分离、培养、扩增和纯化，多次传代扩增后仍具有干细胞特性。
以上是对于间充质干细胞的通常看法，随着研究深入发现间充质干细胞在医疗中的价值远远高过胚胎干细胞、多效诱导多能干细胞等“干细胞明星”，有必要其进行重新认识:
组织支持的"土壤细胞"
间充质干细胞是一种滋养层细胞，可能存在于所有组织中，支持多种细胞的生存和生长，包括：造血细胞、胚胎干细胞、肿瘤细胞、神经细胞、肝细胞、内皮细胞等；
组织修复的”微药厂“
间充质干细胞在体内发生炎症损伤，释放出炎症信号时，持续地分泌相关抗炎性分子、抗凋亡分子等，在体内形成一个促进组织修复及再生的微环境；
信号开关功能
间充质干细胞可能具有自身开/关调控机制，而这个调控机制的关键可能在于体内是否存在有炎症信号；
抗菌作用
间充质干细胞可以分泌一种被称为hCAP-18/LL37具有抗菌作用的抗菌肽；
抗纤维化作用
可以修复血管纤维化、肝纤维化、肺纤维化等；
抗排斥作用
间充质干细胞可以抑制GVHD（移植物抗宿主反应），能够促进造血干细胞植入，还可以降低细胞或器官移植后的免疫排斥反应；
激活内源性干细胞
同种异基因移植间充质干细胞，主要通过分泌细胞因子调节微环境，激活内源性干细胞发挥组织修复作用；
”一过性“使命
同种异基因移植间充质干细胞，必要时可以直接参与组织分化与修复，在完成使命后逐步被内源性组织细胞替换，并不长期滞留体内；
超级起始材料
间充质干细胞体外扩增方便，具有多潜能性，可望成为组织工程、细胞重编程，以及细胞转分化理想的起始材料；
伴随生命全过程
有了间充质干细胞，才有组织发生：单细胞生物只有集落，原肠胚阶段的生物有内胚层和外胚层，仍没有组织分化，每个细胞都可以独立生存；当生命进化或发育到三胚层阶段真正意义上的组织才诞生，而间充质干细胞就起源于中胚层；
遍布所有组织
间 充质干细胞与血管相伴，存在于机体所有的组织、组织液和分泌物中：除了骨髓间充质干细胞、脐带间充质干细胞外，脂肪干细胞、胎盘干细胞、宫内膜干细胞、外 周血干细胞、毛囊干细胞、牙髓干细胞、粘膜干细胞、羊水干细胞、羊膜干细胞、乳汁干细胞、尿液干细胞等等均含有或本身就是间充质干细胞；
身体的脚手架
间充质干细胞是组织的建造者和功能维持者：间充质干细胞在组织形态发生中负责搭建脚手架，分化出骨骼、软骨、脂肪、纤维等结缔组织，构成器官发育框架结构；而且，间充质干细胞可以分泌数十种因子，为各种分化细胞提供所需营养；
建造细胞微环境
间 充质干细胞是各种细胞niche的建造者和维护者：机体各种细胞处在特有的niche之中才能够正常发挥功能，间充质干细胞负责建造各种niche、并分 泌所需的各种因子维护其功能，如：肌细胞niche、神经细胞niche、造血干细胞niche、上皮细胞包niche、肿瘤细胞niche等等；另一方 面，间充质干细胞还通过免疫调节作用隔离不同niche，避免不同性质niche的相互冲突；
组织功能维护者
间充质干细胞是维护组织功能的基础，任何疾病都与间充质干细胞有直接关系：各种物理、化学、生物因素均直接和间接作用在组织的脚手架和细胞niche上，从而引起损伤、感染、过敏、坏死、免疫力下降、内分泌紊乱、神经失调、衰老、癌变等等。
虽然间充质干细胞被认为最接近临床应用的干细胞产品，但随着研究深入，研究者必须对间充质干细胞的局限性予以足够重视：
1.间充质干细胞为异质性细胞群体，定义不明确，大小形态各异，不同组织来源细胞表观遗传印迹不同；
2.间充质干细胞体外扩增能力有限，有效传代次数仅3-7；
3.间充质干细胞体内归巢缺乏特异性，多向慢性炎症部位聚集，难以有效抵达目标组织；
4.间充质干细胞静脉输注绝大多数被肺部截留，系统输注疗效似是而非；
5.间充质干细胞往往并不表现干细胞行为，异基因细胞输注后一般不在体内增殖，不参与定植、分化；
6.间充质干细胞一般不直接参与组织修复，异基因细胞输注后数天至2周内均被免疫系统所清除；
7.间充质干细胞生物学效应繁杂，缺乏明确治疗靶点；
8.间充质干细胞主要生物功能可被生物活性分子组合所取代。
近十年来，国际上共有包括间充质干细胞、胚胎干细胞、神经干细胞等在内的二十多个干细胞制品进入临床人体观察，用于开展治疗心血管疾病、免疫性疾病、神经性疾病、组织损伤等的临床研究。到目前为止共有10个干细胞制品以先进医疗产品、孤儿药、生物制品或药品形式获准上市。
2004年以来国家CDE共受理了10项干细胞新药临床申请，其中“骨髓原始间充质干细胞”、“自体骨髓间充质干细胞注射液”、“间充质干细胞心梗注射液”、“脐带血巨核系祖细胞注射液”获准开展临床试验，但截止2015年3月所有这些干细胞药物均在不同阶段夭折。
国 际上已获准上市的干细胞药品前景也并不太乐观，Osiris公司在探索Prochymal用于治疗成人移植物抗宿主病、克隆症和糖尿病等其他病症时屡屡受 挫，2013年11月该公司将 Prochymal 转让给澳大利亚 Mesoblast公司。2013年11月，FCB-Pharmicell用于急性 心梗治疗的干细胞药物Hearticellgram-AMI第II/III期的临床试验结果显示失败。
下面展示间充质干细胞的庐山真面目：
绿色为细胞骨架，紫色为细胞核，红色为细胞质蛋白。
细胞增殖
体外培养的间充质干细胞迅速增殖并争先恐后地去抢占底盘，这种“定向迁移”能力对损伤修复等至关重要。
细胞铺展
间充质干细胞迁移的方向感来源于特定蛋白质在特定方向上的激活，人为地使这种蛋白质在各个方向都激活，细胞就丧失了方向性，以至于虽然把自己扯成了薄饼，却还是停留在原地。
迁移与分裂
细胞生长过程72h延时视频中间充质干细胞细胞四处爬行，分裂前会突然聚集成亮亮的圆球，然后一分为二。
爬高上低
间充质干细胞可以沿着胶原纤维等胞外基质四处爬行。
与血管同行
图中灰色管状为毛细血管，哪里有血管哪里就有间充质干细胞（红）。
拯救死亡细胞
活细胞染为红色，死亡的心肌细胞染为青色，间充质干细胞不断迁移，箭头所指部位间充质干细胞逐渐与死亡细胞融合成为双核，400分钟时死亡的心肌细胞开始奇迹般地复活。
