慢性疲劳综合征常用的治疗方法为药物治疗与一般治疗。药物治疗：患者可以口服抗抑郁类的药物调节神经以及促进睡眠。伴有头痛和其他部位疼痛的患者还可以服用一些止痛药。患者平时的饮食要营养均衡，同时可以吃一些水果蔬菜来补充身体所需的微量元素。
增强自我保健意识：世界卫生组织指出，个人健康和寿命60%取决于自己，应树立正确健康观，自我管理健康和生命。合理运动：运动可使大脑产生吗啡物质，使人产生欣快感，有效消除身体、心理疲劳，改善紧张、焦虑情绪。
慢性疲劳综合症，是比较复杂的病，跟多种因素的影响都有关，类似于虚劳，疲劳与气血亏虚有关，若光靠休养是远远不够的，还应该及时补气养血来调理身体。对于由气血亏虚引起的疲劳，生活中要改掉不良的生活方式，避免过度劳累，尽量减轻精神压力，补益气血进行调理。
慢性疲劳综合征，是一组持续或反复发作的疲劳，伴有多种神经、精神症状，但无器质性及精神性疾病为特点的症候群。因慢性疲劳综合征的临床症状复杂，一般体检及实验结果又无重大异常，通常表现程度不同，症状也轻重不一。
慢性疲劳综合征是指在排除其他疾病的情况下，连续6个月或以上出现以下症状中的4个症状，短期注意力不集中、记忆力下降、咽喉痛、淋巴痛、肌肉莫名痛、关节无红肿性疼痛、新发头痛、睡眠后精神萎靡、体力或脑力劳动后连续出现24小时以上身体不适。作息不规律、熬夜、睡眠不足、过度劳累、精神心理压力大，容易引起慢性疲劳综合征。
慢性疲劳综合症多半有心理上的消极表现，由于慢性疲劳综合症的症状多是亚健康的表现，服用药物可能效果不佳，最重要的是缓解自己的心理压力，依靠锻炼身体、饮食调节等方法来提高自己的身体素质。慢性疲劳综合症是身体和脑力疲劳为主要表现的一组症候群，可以表现在身体多个方面，例如消化系统、循环系统、生殖泌尿系统等。