上厕所的时候肛门出现特别疼痛就是肛裂，肛裂是那种撕裂样的疼痛，可以尝试外用涂抹药物进行治疗，当药物治疗效果不理想的时候，它可以通过手术的方法进行治疗，但治疗要保持大便的通畅。
肛门疼痛的原因主要因肛门的神经非常丰富，感觉敏锐，当受到刺激的时候容易造成疼痛，表现为坠痛、胀痛、烧灼样痛等。肛门疼痛主要是肛门内及肛门直肠周围的一种疼痛症状。
如果肛周脓肿或有肛周围有疖，应该到医院肛肠外科，进行检查，确诊后再进一步治疗，也可以使用槐花散进行清热解毒调理。平时注意休息，避免劳累、熬夜，注意卫生。饮食要清淡，不要吃辣椒等辛辣刺激食物，注意饮食忌油腻，忌辛辣。多吃蔬菜水果，多喝水，戒烟酒。多吃香红薯可以起到软化大便的作用，多喝酸奶，以保持排便通畅。
大便时肛门疼痛可能需要排查外痔和肛裂因为这两者都是常见的引起大便时疼痛的原因，当然还有其他原因引起的可能。慎重起见，同时也为了对患者负责，还是去正规医院看看肛肠科，做一些必要的临床检查，如肛门检查等，以明确具体诊断，方便临床进一步的治疗。
肛门疼痛，考虑的是痔疮或肛裂的发现，因为大便干燥会刺激肛门发炎或痔疮，会引起疼痛，或到肛门直肠科室检查，或服用少许抗炎和火药，然后使用外用药物，也能缓解疼痛，但在检查和诊断后加以治疗。