避免挤压。保持肛周清洁卫生。多喝水，多吃蔬菜水果，忌辛辣等刺激性食物。治疗得当，保养得好，一般两周左右即可恢复正常。如两周后仍无恢复或病情加重，应到正规医院肛肠科检查就诊。
传统的手术治疗比较麻烦，通常需要进行两次手术，第一部分是化脓清除，并在一段时间后当脓液破裂形成肛瘘，然后做肛瘘手术。更严重的脓肿腔破裂后会形成的复杂肛瘘，很难准确地发现脓的来源，这不仅治疗并不完整，但也对病人带来巨大的痛苦。需要1-3个月的恢复时间，复发率较高。
轻微肛周脓肿需要治疗一至两周左右的。可以理疗、外敷中药或用抗生素作局部注射等方法来进行治疗，也可以每天使用温水在温水中加入生理性质的盐水进行坐浴的治疗，来缓解轻微肛周脓肿的情况。
肛周脓肿这就是局部有细菌感染，有炎症造成的。需要吃点消炎药的，可以每天用热的淡盐水肛门坐浴熏洗10分钟，来预防感染的发生及促进创面，保持大便通畅，不要干燥和腹泻，禁止吃一些辛辣刺激的，酒，海鲜类的食物。
轻度肛周脓肿可以自愈，在此期间，要注意饮食，避免进食辛辣刺激性食物，避免长时间坐着蹲着，可口服或注射广谱抗生素，防止炎症扩散，缩小其限制和缓解肿胀和疼痛，如果保守治疗不明显并且脓肿逐渐增加，则需要手术治疗。
婴儿肛周脓肿自愈几率比较小，经过积极治疗后，一般3-6周能痊愈，具体分析如下：
婴儿肛周囊肿多表现为肛周肿胀、疼痛等症状，肛周脓肿一般不能自愈，通常需要及时去医院进行检查，并进行针对性治疗，积极进行治疗以后，3-6周能痊愈。林外，切开引流是肛周囊肿的首要治疗方法，通过手术进行彻底清理，加上抗感染药物配合，3-6周可以治愈。
