肛周脓肿的治疗比较复杂，不仅不可能自己愈合，而且就是用药物进行治疗也很难治好，所以，治疗肛周脓肿应该使用手术治疗。少数肛周脓肿用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散，旦诊断明确且局部已经成脓肿应手术。
俯卧舒展：俯卧并将身体尽量伸直，双臂向前伸直，头部轻微抬起，双臂尽量向前伸展及双脚尽量向后伸展；猫姿伸展：这套动作形如猫儿伸展一样;首先，俯卧在地上，双臂向前伸展，俯身手掌触地，然后将膝盖以上身体向后坐至臀部接触脚跟，双膝贴地做跪状，臀部贴脚跟，尽量舒展手臂、头和背部。
肛周脓肿属于肛周脓肿感染。肛周脓肿发作后，需要尽快手术。暂时性症状缓解手术属于肛周脓肿切开引流，但不能完全治好肛周脓肿。肛周脓肿切开引流后会形成肛瘘，因此仍需进行肛瘘二次手术。
肛周脓肿可以做收缩肛门的运动，也叫提肛运动。肛周脓肿手术后头几天还是要尽量少运动，多卧床休息。这种运动对于卧床，久坐的白领，久站的劳工等都有好处，平时要注意卫生。
肛周脓肿术后饮食根据肠胃肠道内环境来调控，不需要早期就控制饮食，建议做完手术后，恢复到正常饮食即可，比如可正常吃点米饭、蔬菜、肉食。早期时可适当控制，注意清淡饮食，海鲜、海产品、菌类，以及容易引起肠道不适的食物要适当控制，一般不需要对饮食有太强要求。