肝脓肿的手术费用在治疗具体情况存在不同。脓肿比较小，只需穿刺引流，治疗费用在1000元，肝脓肿比较大，需要手术，或者穿刺引流时间长，手术费用在5000元到6000元，在没有并发症的情况下能达到1万元，如果出现并发症可能更高。
肝脓肿在脓腔消失后，症状消失，炎症完全控制后就可以达到治好了。防止本病的关键是注意饮食卫生，预防病从口入，在传染源头上下功夫，切断传染源，将被传染的可能性降到最低。衣着适量，床褥勿盖过多，及时更换汗湿的衣裤和床单，以保持清洁和舒适。
治疗肝脓肿的药物是碳青毒烧类、第二代头抱菌素、氨基首类等药物。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。常用的药物有碳青毒烧类、第二代头抱菌素、氨基首类、甲硝唑、替硝唑等。
建议患者在用药期间注意饮食清淡，避免吃辛辣、油腻的食物。
肝脓肿的治疗周期应根据肝脓肿的治疗情况而定，没有固定的时间，一般至少需要2-3周。肝脓肿治疗方法有抗生素抗感染及营养支持与穿刺引流，手术治疗等。
肝脓肿与阿米巴性、口腔、心内膜炎、胆囊炎、阑尾炎等继发的感染有关。选用不超过3cm的敏感性抗生素，不能完全使用液态的抗生素。大的要进行手术，但不能达到预期的程度。
首先不能吃生姜，姜则不利于疾病的痊愈，其次是大蒜，大蒜中的某些成分对胃，肠有刺激作用，可抑制肠道消化液的分泌，影响食欲和食物的消化，加重肝脓肿病人的厌食，最后不能吃高蛋白、高脂肪的食物，平时注意休息，避免过于劳累，饮食应清淡，忌食辛辣油腻刺激食品。适当的锻炼身体以增强体质。