木耳不能和富含维生素K的食物一起吃。木耳能减低血液黏稠度，能抑制血小板凝集，是天然的抗凝剂。维生素K具有凝血作用，对于血液凝集起着关键作用，所以二者不能一起吃。食物中豆类、蛋黄、胡萝卜、菜花、西红柿、菠菜、油菜、生菜等绿色蔬菜，苹果、梨等也含有维生素K。由于常吃木耳有抑制血小板凝集的作用，所以有出血性疾病的人要慎食。新鲜木耳含有卟啉物质，之后经日光照射会引起日光性皮炎，所以不要吃新鲜的木耳。
木耳不能和萝卜一起食用，否则容易导致过敏的现象发生。木耳也不能与麦冬一起吃，否则会引起胸闷的症状发生。而且，木耳也不能与海螺、田螺一起吃，否则会容易导致食物中毒。
木耳是不能和萝卜一起食用的，萝卜中还有比较丰富的水分，而木耳中含有比较丰富的去黑元素，木耳和萝卜一起吃容易引发皮肤过敏现象。对于过敏体质的人群来说，更容易引发皮炎。
木耳菜不能和豆腐、牛奶、酱油等一起吃。耳菜+豆腐：木耳菜属于弱酸性食物，而豆腐属于弱碱性食物，把豆腐和木耳菜搭配在一起吃，会发生酸碱化合反应，导致豆腐和木耳菜中原有的营养成分流失，所以二者分开食用。
木耳和芹菜是可以一起吃的。木耳和芹菜的物质成分不仅没有冲突，而且两者的营养功效非常相似，是非常适宜搭配食用的两款食材。木耳和芹菜的铁含量都较高，两者搭配食用具有很好的补血止血的作用。
虾可以和木耳一起吃。从食物的营养成分上来看，木耳性平，富含植物蛋白、多糖、维生素K以及钙、磷、铁等元素，而虾以动物蛋白、钙、磷、铁等营养元素为主，两者成分不相克，可以同食。