跑完步休息后发现膝盖窝外侧非常疼有可能是因为膝关节滑膜受到刺激导致的，有可能是因为半月板出现过度的挤压、摩擦导致的水肿引起的，膝关节外侧的副韧带出现过度的牵拉、痉挛也会出现疼痛。
造成膝盖酸痛的因素有很多种，既可能是由于运动过猛，又可能是由于长期过度劳累，半月板受损，因此可适当休息，然后屈伸腿看看有没有还疼的感觉，但是如果膝盖肿了或痛得厉害的话，则建议到医院进行拍片检查，医生还可根据膝盖严重程度进行针对性处理，患者需要注意的是，平时可注意热敷，按摩或推拿，应加强休息，不应激烈活动。
一般情况下，可能是长时间的奔跑以及不合适的跑步方式导致膝关节酸痛，具体内容如下：
如果患者有长时间的奔跑以及不合适的跑步方式的情况，膝盖在奔跑时受到的撞击和磨耗更大，因此在跑完以后会引起膝盖的酸痛。特别是长期的奔跑，会造成膝关节的滑膜炎、关节积液、膝关节的软骨面、膝关节的韧带损伤等情况，从而会导致膝盖疼，建议患者平时多注意休息，适当跑步，采取正确的跑步姿势，有利于身体健康。
多考虑是运动量大，牵拉牵扯。导致腰部疾病发生，应及时去正规医院专科就诊。应及时做腰部ct检查排除是否，腰椎间盘突出。平时适量运动，避免牵拉。避免久坐，多睡硬板床，平时补充营养神经的食物。
跑完步腰疼可能是肌肉牵拉、肌肉劳损、腰椎间盘突出等原因造成的。
跑步结束后可能会有腰部疼痛的这种。在跑步的过程中，身体的左右两边会不断的前后摆动，久而久之会引起腰的肌肉纤维的拉扯，引起局部的充血肿胀，从而产生无菌的炎症，从而引起疼痛，特别是骨头的软组织，这种感觉会比较强烈。同时，由于体内乳酸、二氧化碳等酸性物质的积累，以及体内钙元素的不足，也会引起腰酸。在过于潮湿和寒冷的环境中，疼痛会变得更为严重。如果是因为奔跑而造成腰椎间的椎间盘突出，那么脊柱内部的气压就会发生改变，从而通过窦椎的神经传导到腰椎，从而造成腰酸背痛。
跑步后有肩膀酸痛现象，也许跑前没热身运动，致使在奔跑过程中，因肩膀活动度大，造成拉伤。如果是在剧烈性运动或者长时间站立时，容易造成手臂和肩部肌肉酸痛，甚至还会引发关节扭伤。此外，还可能自身患有肩周炎，跑步后诱发产生疼痛。
出现这种情况之后，患者合理休息才是最重要的，此外还可配合推拿等物理治疗，按摩，还有外敷消肿止痛，活血化瘀之药膏，可以有效改善症状。