心脏室间隔增厚是由于心血管疾病导致，比如高血压病、心脏病、心肌病等，所以室间隔增厚的治疗需要针对原发疾病来治疗，控制血压，使血压控制在正常范围，会减少对心脏间隔的损伤，延缓并发症的发生。如果有心肌病积极治疗心肌病，平时生活和饮食上多注意限制钠盐的摄入，避免劳累和剧烈运动，长期服用丹参片或者活血化瘀通络的其它中成药来降低心脏负荷，减少对心脏的损害。
心脏室间隔缺损会导致体循环缺血和肺循环淤血，甚至出现艾森曼格综合征。
长时间的心脏室间隔缺损会导致右心室的压力逐渐增加，导致肺动脉充血，使肺循环压力负荷增加、肺静脉回流增加、左心房扩大、左心室扩大、右心室压力进一步增加，最终导致出现体循环缺血和肺循环淤血的症状。体循环缺血主要表现为外周重要脏器的供血不足，比如儿童生长发育迟缓、消瘦、乏力、出汗等。肺循环淤血表现为反复的呼吸道感染，长时间会导致下肢肿、肝大等全身性症状。疾病到晚期右心室压力过大会形成右向左分流，也就是艾森曼格综合征，患者会出现青紫。
建议母亲孕早期有明确的病毒感染，建议做胎儿心脏超声检查，心脏室间隔缺损检出率较高。
一般情况下，先天性心脏室间隔缺损可以通过以下方式进行治疗：
先天性心脏室间隔缺损，是一种在胎儿发育过程中，由于心脏的不完整而引起的一种先天性心脏病。可能出现气促、呼吸困难、多汗、乏力、反复感染等症状。如果是轻微的，没有什么特别的表现，可以通过日常的饮食和常规的检查来改善。如果是在初期有心脏功能不全的情况下，建议做手术治疗。
治疗方法控制血压，低盐、低脂饮食，定期到医院进行复查病情，看有没有进一步发展，如病有变化及时到医院就诊，必要时行手术治疗，平时注意休息，保持充足的睡眠。注意饮食健康，以清淡食物为主，避免生冷辛辣刺激类食物。适量的户外运动，保持心情舒畅，不要有太大的心理压力。
室间缺损是指胎儿期的室间，未完全发育，在室壁上出现了一种不正常的交通。其主要特征是：肺组织缺损的面积、肺动脉血流和气压的强弱、微小的缺损、少量的分流、没有明显的临床症状。中等程度的缺陷，在新生儿时期就会有明显的表现，主要表现为大面积的缺陷，在新生儿的一两个月内，会有呼吸困难、大量的汗水、严重的喘息、脸色发青、晚上容易发脾气等症状。
目前心脏有室间隔的肥厚，主要考虑是长期的高血压刺激导致出现的。目前主要是需要应用降压药物，保证血压的正常，尽量要少喝酒，同时也要保证良好的情绪，不要过度的劳累。