如果特别疼痛，可以局部外用一些止痛的药物。还有一种较重的口腔溃疡叫做腺周口疮，是一种较大而深的口腔溃疡，愈后可能会留有瘢痕，相对而言，这种口腔溃疡也有一定的自限性，大概在1个月左右就会有明显的好转。临床上需要注意的是1个月以上，而病变范围逐渐增大的溃疡，可能会有癌变的风险，必要时可以做局部活检来明确诊断。
口腔溃疡属于一种病因不明的疾病，临床口腔溃疡由于病因不明，治疗的方案就是对症治疗。口腔溃疡临床治疗没有什么特效的疗效，一般七天左右可以自愈。补充维生素对口腔溃疡愈合有很大的帮助。
口腔溃疡就是口腔黏膜上皮的全层破坏，最常见症状是疼痛，最常见的溃疡是复发性口腔溃疡（复发性阿弗他溃疡）、口炎型口疮、腺周口疮，后两种溃疡都会严重影响病人的生活，所以主张药物治疗，首选药物是糖皮质激素，和免疫调节剂，还可以选择中医中药治疗和调整。
口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
药物治疗：配合中西类止疼消炎的药物来进行治疗。免疫力治疗：由于该病原因复杂，如果由免疫力降低引起，想缓解病情还得提高自身免疫力，必要多补充维生素，来补充流失掉的微量元素。
口腔溃疡的治疗，主要是去除病因、增强体质、对症治疗。首先应该去除口腔内的不良刺激因素，比如残冠、残根、不良修复体、不良正畸等，同时戒烟限酒，不要吃辛辣刺激性的食物。其次多吃水果、蔬菜，多吃高蛋白的食物，补充机体所需要的营养及维生素。进行适当的体育锻炼，保持愉悦心情。口腔溃疡的局部保持清洁。