可以通过服用利水渗湿祛湿的药物来治疗，如果肾囊肿比较小是可以起到一定的效果的。中医认为本病多是由于肾精不足、痰瘀阻滞、脉络不畅所致。平时饮食宜清淡，注意防寒保暖，避免过度劳累。
如果患有肾囊肿，通过西医手术治疗，大多数情况下肾囊肿不超过五公分是不需要做任何治疗的。肾囊肿是属于良性肿瘤的，不会给身体带来过大的影响。是保持愉快的心情就可以了，不用过于担心。
胎儿肾囊肿无需进行治疗。
因为胎儿肾囊肿的发病原因，与遗传因素或者先天发育异常有关。绝大多数的囊肿都属于良性病变，生长速度非常缓慢。单发的肾囊肿，对于胎儿的身体健康以及出生后的身体健康，都没有明显的不良影响，通常是不需要进行特殊治疗的。如果囊肿体积增大，可以进行手术治疗或穿刺抽液治疗。但如果对胎儿的身体较大时，应选择终止妊娠。
中医治疗肾囊肿的方法有很多，患有肾囊肿要注意饮食忌口，少吃一些咸的、辛辣的食物，少吃污染的食品和烧烤类食品，多吃富含维生素或蛋白质的食物。生活中不要憋尿，经常清洁伤口。
肾囊肿较小的一般无需治疗，单纯性肾囊肿对周围组织和肾功能影响不大，无需特别关注，若囊肿直径超过10厘米，则要进行手术切除，通过腹腔镜的方法，可对肾囊肿进行去顶，通过释放囊液，达到治疗效果。饮食上要补充高纤维，高维生素的食物，如玉米，小麦等，多吃新鲜的水果蔬菜，戒烟戒酒，不要吃辣椒，海鲜，油炸性食品。