一般来说，新生儿脊柱裂小凹可通过手术、日常调理等方式进行治疗，具体如下：
通常情况下，新生儿脊柱裂小凹可能是脊柱骨骼发育不健全导致的，通常需要进行手术治疗。
在日常生活中，患者应保持休息环境安静、舒适，规律作息，保证充足睡眠，避免熬夜、过度劳累，定时进餐，多吃新鲜食物，控制糖摄入量，适当多吃富含维生素的新鲜水果和蔬菜。
新生儿如果出现了脊柱裂，脊柱裂是胚胎发育过程中，椎管闭合不全而引起。新生儿脊柱裂是脊椎管的一部分没有完全闭合的状态，是一种常见的先天性神经管畸形。要依照病情确定是否手术，隐性脊柱裂、无神经组织的囊肿切除后不妨碍健康。
对于隐性脊柱裂，要根据病情轻重来进行治疗。这要看是不是偶然发现的，或者是在检查后出现了症状，然后根据患者的具体情况，进行相应的治疗。
如果不伴有脊膜膨出和脊髓栓系，一般不需要治疗，只需要做临床观察。如果有隐性脊柱裂伴有脊膜膨出，或伴有其它神经系统症状时，应进行神经外科介入治疗。介入治疗，是为了防止神经功能紊乱进一步恶化，让病人的神经功能逐步恢复。
脊柱裂患儿死亡率、病残率均较高，如胎儿临产前确诊脊柱裂应推荐引产。
如脊膜膨出不甚明显，亦可继续怀孕。妊娠期间必须经常到产前检查并密切注意胎儿发育情况。隐形的脊柱裂，产前B型超声检查时，常不易被察觉。较粗大脊柱裂产前B型超声较易检出，孕18～20周为最佳检出时间。平时需注意饮食健康，定期孕检，筛查胎儿先天疾病。
小儿脊椎裂属于一种神经发育异常，一旦发生脊椎裂，会导致儿童走路不正常、大小便失禁甚至瘫痪。这个病症和孕妇身体中的叶酸有很大的关联，因此在妊娠的3个多月里要注意补充叶酸，直到妊娠三个多月。
此外，怀孕期间可以做B超、羊水检测等检查，如果能及早的诊断出胎儿的症状，就需要进行相应的处理，以免错过了最好的时机。
