巧克力囊肿子宫内膜异位症的一种，是外源性子宫内膜异位症的一种，这种病在西医上北称为：“不死的癌症”是一种经久反复的疾病。这种病中医保守治疗。中医保守治疗只要对症就能见效，中医保守治疗后复发率低。对于有生育要求的，建议中医保守治疗。
卵巢巧克力囊肿疾病最突出的症状就是痛经，会让出现经期腹痛的感觉，而且性交的时候也会有可能出现疼痛感，所以说出现疼痛的感觉就应该警惕起来，一般还会伴有不孕的症状出现，月经改变也比较明显，需要及时确诊和治疗，防止疾病加重很关键。
要注意自身保暖，避免感寒着凉。月经期间，禁止一切激烈体育运动及重体力劳动。青春期要避免受惊吓，以免导致闭经或形成溢流。学会控制情绪，不要生闷气，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。卵巢巧克力囊肿大于7厘米以上者，在月经期或月经中期一定要情绪稳定，避免过度劳累。一旦囊腔内张力突然升高，囊壁破裂，会形成急腹症。注意定期进行B超复查，以便及时发现囊肿的复发，在其较小的时候采用药物治疗。
发现患有巧克力囊肿的时候一定要积极的进行手术的方式治疗，因为手术的方式治疗卵巢巧克力囊肿是目前为止能够较为彻底地清除囊肿的一种治疗方式，而且通过手术的方式还可以有效的缓解痛经，提高生活质量，对于有不孕症的病人，手术之后妊娠率能够得以提高。
巧克力囊肿，会降低怀孕几率的，是手术治疗以后再怀孕比较安全。是治疗后在怀孕，以免引起怀孕几率下降。如果已经怀孕，巧克力囊肿是不会影响到胎儿发育的。如果怀孕后期没有骨盆异常可以尝试阴道分娩。
术后注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常，手术后注意增加蛋白质的摄入量。蛋白质可以帮助伤口快速好，可以增加体力。选择鱼类，鱼肉比较容易消化和吸收。注意休息，禁食辛辣生冷刺激东西，适当活动，增强身体抵抗力。