卵巢囊肿大小直径超过五公分，首选的是手术治疗，目前选择的都是腹腔镜的微创手术。卵巢囊肿手术在，术前与病人沟通的时候，医生都会交代，卵巢囊肿术后有复发的可能性。因为是个卵巢囊肿的单纯性的切除，而不是连同卵巢一同切除，只要有卵巢存在，有靶器官存在，就有复发的可能性，因此说卵巢囊肿手术后都有复发的可能性。
卵巢囊肿手术切除之后，女性的卵巢里面卵子的生产量就会明显降低，之后女性的受孕能力就会受到影响，而且还会引发其他的子宫卵巢疾病，主要是包含卵巢交界性沾粘，需要定期去医院做检查，子宫切除是属于妇科疾病，最常见的解决方法之一。而且需要分析卵巢囊肿的性质，如果是良性的话，平时应该注意身体，尽量多吃点清淡的食物。
卵巢囊肿的确是有一定的复发的可能性，术后的复检调理工作的确是需要做好的，尤其是需要注意，内分泌情况一定要调理好，避免出现紊乱，这是造成卵巢囊肿的一个复发因素。平时要注意生活规律，不要熬夜，注意卫生，应当勤换内衣裤，清洗衣物时要分开。保持心情舒畅，适当运动。
卵巢囊肿切除后是否会影响怀孕，需要根据实际情况决定。如果双侧出现了卵巢囊肿，并且采取手术切除，就会彻底的导致不孕不育了，因为卵巢是分泌雌激素和卵子的器官，切除以后就完全丧失了人体生成卵子的部位，从而会导致不孕不育的。但如果是一侧卵巢囊肿切除，一般对怀孕的影响不大，因为切除了一半，还有另一侧的卵巢可以分泌身体的激素以及进行受孕。
卵巢囊肿切除术后，应做病理切片进一步明确卵巢囊肿性质。术后应定期进行检查，因卵巢囊肿形成机理不明，卵巢排卵、卵巢组织增生则仍可再次形成卵巢囊肿。如较常见的卵巢巧克力囊肿，易复发，需通过使用口服避孕药、GnRH预防复发。
卵巢囊肿是有复发可能的，手术只能把可见的巧克力囊肿剥除，但不能保证将潜伏着的很小的巧克力囊肿彻底清除。而由于手术本身具有破坏性，一定程度上又会刺激这部分残留的巧克力囊肿生长。因而术后复发率较高。
