巧克力囊肿严重，造成女性月经不正常，出现月经不调的症状，还有些女性还会出现腹痛、性交痛等症状，都会给女性造成很大影响，因为巧克力囊肿引起囊肿的破裂，就会使得盆腔内积血，造成剧烈的腹痛。
巧克力囊肿20厘米是非常大的，对于巧克力囊肿的病患需尽快进行手术治疗，术后要服用一些药物进行抗炎治疗。如果确定是巧克力囊肿，不进行手术还会继续增大的，可以进行手术治疗，治疗后一个月正常转经后就可以进行备孕的。
卵巢巧克力囊肿通常就是由于，子宫内膜异位到卵巢上生长而形成，常见于多次的输卵管通液手术或者是人流手术等原因导致引起，或者是在月经期同房以后导致月经血逆流，而导致引起的子宫内膜异位到卵巢的表现，当卵巢巧克力囊肿小于五公分以下，而且没有引起明显的痛经，这时候就可以不用进行特殊的处理治疗。
巧克力囊肿大就是不正常的，巧克力囊肿分为前期巧克力囊肿和后期巧克力囊肿。前期巧克力囊肿的囊肿直径小于等于3厘米。前期巧克力囊肿症状比较轻微。一般囊肿直径小于等于3厘米，算正常的。
巧克力囊肿是子宫内膜异位的一种，所以尽量多吃蔬菜水果，杂粮，有营养的食物，少吃海鲜，活血的营养品，经期不要吃寒凉食物，保持愉快的心情，充足的睡眠，还有要腹部保暖。