最常见的原因为泌尿系感染，尤其是下尿路感染，即膀胱炎，可出现明显的尿频、尿急、尿痛等尿路刺激症状，也可伴有血尿，化验尿常规可见尿中白细胞及细菌数明显增多。另外结石也可导致尿痛，行泌尿系超声检查可明确诊断。部分为淋球菌性尿道炎，可出现明显的尿痛，伴尿道口分泌物增多，行分泌物化验可确诊。
尿黄、尿痛在临床上很多见，常见的原因是慢性前列腺炎：多见于中老年男性，可出现尿痛、尿液颜色深、尿频、会阴部及小腹胀痛等症状出现，治疗多以解痉止痛抗炎及理疗等综合治疗。
考虑尿路感染，通常与细菌、衣原体、支原体等感染有关的，必要时可以作细菌培养，明确是否存在感染以及感染的病菌种类以及敏感的药物后有针对性的使用消炎药治疗。
男生尿黄尿痛的原因主要有慢性前列腺炎：多见于中老年男性，可出现尿痛、尿液颜色深、尿频、会阴部及小腹胀痛等症状出现，治疗多以解痉止痛抗炎及理疗等综合治疗。所以出现尿黄尿痛的时候，要及时的去医院检查进行治疗。
局部尿路受到细菌的刺激，导致出现尿痛的情况，平时注意休息，急性期短期内避免性生活，避免吃生冷辛辣刺激容易上火的食物，不要憋尿，增加活动，必要时可以去检查一下尿常规。
女性尿黄尿痛是泌尿系感染的问题，可以查一个泌尿系的b超或者是查一个尿常规看看。用盐水，花椒水先洗外面观察看看。平时注意局部卫生。性生活不注意或者是平时不注意卫生，都可能会导致泌尿系感染。