治疗神经膀胱炎的主要保护肾脏功能，防止肾盂积水，肾积水导致慢性肾功能衰竭，其次是改善排尿症状以减轻其生活上的痛苦。治疗的具体措施是采用各种非手术或手术方法减少残余尿量，残余尿量被消除或减至很少（50ml以下）之后可减少尿路并发症。
神经性膀胱炎就是控制排尿功能的中枢神经系统，或者是周围神经受到损害，引起的膀胱尿道功能障碍。目前临床常用的治疗方法为保守或手术治疗，保守治疗可以终身间歇性导尿，应用药物、或针灸、或封闭、进行膀胱训练等，若保守无效者可考虑手术治疗。
神经性膀胱炎在出现了后，一定要重视，特别是要到正规的医院进行系统的治疗，治疗的方法也比较多，常用的主要是药物治疗，需要在医生的指导下进行合理的用药，另外，也可以通过中医进行治疗，针灸就治疗效果很好，在平时要增强体质，生活和饮食有规律。
要注意适当的休息、多饮水、多排尿、注意营养，饮食上不要吃刺激性的食物。症状比较明显的病人可以给碱性药物，没有症状的菌尿不需要常规抗生素治疗，但是需要密切观察，症状比较明显的患者需要用抗菌药物。
膀胱炎是发生在膀胱的炎症，主要由特异性和非特异性细菌感染引起，还有其它特殊类型的膀胱炎。膀胱炎的治疗如果只是局限在膀胱的感染，没有上尿路感染，建议口服抗生素，大量饮水。