治疗输精管堵塞关键要看具体病因，不同的原因会有不同的治疗方法，分情况而论，可采用不同的手术方法来解决问题，积极配合治疗还是有希望的。到具有不孕不育专科医院进行全面的检查，医生会根据病情给予针对性的治疗。
得了轻微输精管堵塞，如果没有生育要求，可以不用医治。但是如果有生育要求，甚至在备孕期间，是需要及时医治的，轻微输精管堵塞会导致不育，因为男性的精子不能通过输精管被排出，而是停留在了输精管堵塞的部位，就会使得精子不可能和卵子相遇形成受精卵了，而没有受精卵就更别提生育了。
单侧输精管道阻塞，对生育影响不大；双侧堵塞时，精子不能正常排出，将导致不育。确诊为梗阻性无精子症者，原发病治疗。首先去除原发病因，对于感染因素造成者先抗感染治疗，再考虑再通手段。肿物切除术。精索、精囊、前列腺肿瘤或囊肿，或者周围其他器官肿瘤、囊肿产生压迫者，可行手术切除。输精管附睾吻合术。病变在附睾尾部，可行输精管附睾吻合术。
轻微输精管堵塞的症状：由于炎症，外伤，肿瘤压迫导致的输精管堵塞时，会有性高潮减弱，射精无力，射精疼痛等表现。输精管先天未发育或发育不良、与附睾不相通等，常伴精囊不发育，致精液量少，无精子。输精管堵塞病情发展至后期时，有经验的医生通过体检触及输精管或附睾结节、增粗、串珠样改变或缺如。
轻微输精管堵塞调理首选针对梗阻的原因和部位，恢复输精管道的通畅。对于无法再通的病人考虑行ICSI。精索、精囊、前列腺肿瘤或囊肿，或者周围其他器官肿瘤、囊肿产生压迫者，可行手术切除调理。
治疗时首先应针对原发病治疗，如抗炎、抗痨、抗肿瘤等，亦可将堵塞处切除后进行断端吻合，个别情况下可直接从附睾处吸取精子进行人工受精。中医认为输精管堵塞是由于瘀血阻塞精道所致。从而使肾精下泄受阻，无法泄精受孕，并将其分为寒滞血瘀和湿热瘀阻两型。治疗时活血化瘀，祛瘀生新，以使阻塞的精道重新复通。