治疗输精管堵塞关键要看具体病因，不同的原因会有不同的治疗方法，分情况而论，可采用不同的手术方法来解决问题，积极配合治疗还是有希望的。到具有不孕不育专科医院进行全面的检查，医生会根据病情给予针对性的治疗。
输精管堵塞不是一个独立的疾病，而是多种疾病造成的一种症状。治疗时首先应针对原发病治疗，抗炎、抗痨、抗肿瘤等，亦可将堵塞处切除后进行断端吻合，也可以采用中医疗法，用中药来调节。
得了轻微输精管堵塞，如果没有生育要求，可以不用医治。但是如果有生育要求，甚至在备孕期间，是需要及时医治的，轻微输精管堵塞会导致不育，因为男性的精子不能通过输精管被排出，而是停留在了输精管堵塞的部位，就会使得精子不可能和卵子相遇形成受精卵了，而没有受精卵就更别提生育了。
不会自然自愈。会引起无精症导致不孕症的发生。可以做一下输精管通液术，如果输精管经过通液术治疗以后通畅了，化验精液常规显示有精子活力正常，就可以正常备孕了。
抗感染治疗。男人有输精管堵塞若是由于生殖道感染引起的，此时在治疗上需要进行的就是抗感染治疗，抗感染治疗可以帮助男性及时控制炎症，帮助水肿的消退，只要治疗好了相应疾病之后，就可以恢复输精管恢复通畅。输精管附睾吻合术。进行手术治疗的工作，可以进行的手术就是输精管附睾吻合术，如梗阻输精管可进行的就是梗阻段切除，然后进行输精管端吻合术，治疗之后就可以而恢复输精管通畅。人工精液囊。
单侧输精管道阻塞，对生育影响不大；双侧堵塞时，精子不能正常排出，将导致不育。确诊为梗阻性无精子症者，原发病治疗。首先去除原发病因，对于感染因素造成者先抗感染治疗，再考虑再通手段。肿物切除术。精索、精囊、前列腺肿瘤或囊肿，或者周围其他器官肿瘤、囊肿产生压迫者，可行手术切除。输精管附睾吻合术。病变在附睾尾部，可行输精管附睾吻合术。