窗口期极少有症状，即使出现症状也多是低烧。持续一月的见于中期。而具体症状情况是因人而异的。从这方面难以判断确认，如果曾经有高危行为，可以通过检测来确定是否感染。
主要是人体感染艾滋病病毒之后免疫力受到破坏，以及艾滋病所引起的免疫紊乱，导致的一些胃肠道的生态菌群紊乱，所以出现腹泻。艾滋病的腹泻特点反复不愈，通常会伴随有皮疹，淋巴结肿大，发热等全身症状的表现。一般在感染艾滋病病毒三周左右出现，持续2到3周可以自行缓解。在艾滋病感染四周之后，进行艾滋病抗体的检测结果就是阳性的。
艾滋病窗口期的症状并不是说会持续性的腹泻和皮疹，有部分人群会有腹泻头晕体温升高，但不是每个人都会出现皮疹，也是特征性的并不是说每个人都存在。主要就是高危行为接触后，突然之间发生体温升高，人没有力气，然后出现这种症状，需要排除艾滋病的可能。
艾滋病窗口期后腹泻症状主要有感冒发热和拉肚子的症状。艾滋病的初期症状发生在高危2-4周，类似感冒的症状，不是单存的腹泻，如果两周检测结果阴性，暂时可以排除感染，建议三个月以后在检测一次，结果阴性可以彻底排除感染。
艾滋病窗口期腹泻的特点包括持续的时间比较长、次数较多，并且可在一定的时间内恢复，同时可伴有持续的高热或者淋巴结肿大等。对于艾滋病以腹泻来确诊是不科学的，应该结合其流行病学史，如果既往有血液的接触或者是高危的性接触，后期出现了腹泻、发热、淋巴结肿大等问题，此时是需要重视的。后期应该在六周左右进行HIV抗体的检查，如果为阴性，可初步排除感染。
艾滋病窗口期症状有：淋巴结肿大、皮疹、盗汗、头痛、咳嗽、长期低热、慢性腹泻、体重下降、咳嗽、口腔病变、关节痛、肌肉痛、斑丘疹、荨麻疹、腹痛、腹泄、卡波济肉瘤。建议艾滋病2-4周最长8周可以检测出来。