湿疹的治疗宜根据病患的个体化需求，兼顾病患的年龄、疾病的严重程度、部位、是否存在感染、对过去治疗的反应及经济状况等综合考虑。寻找和避免各种可疑的致病因素：如发病期避免辛辣食物及酒类，有鱼虾过敏者忌食鱼虾等。
肛门湿疹可以采用药物治疗，平时保持室内整洁舒适，避免潮湿刺激。参加体育锻炼，增强体质，避免过度疲劳和精神过度紧张。肛门清洁剂是水，勿用热水或肥皂清洗，不乱用刺激性止痒药物。避免各种外界不良刺激，以免复发。
局部出现瘙痒不适。对于应该去医院皮肤科或肛肠科等就诊，外用药物治疗，如果有痔疮及肛瘘等肛肠疾病的话则要积极予以处理，只有如此才可能及时治好，注意局部清洁卫生，饮食清淡避免辛辣刺激食物。可以注意清洁卫生。
肛门湿疹的话应该去做一个肛门镜具体检查一下，从原发病方面着手治疗，效果会好的快一些，保持大便通畅，便后要清洗肛门，避免久坐久立，进行适当运动，睡前温热水坐浴等。
如果症状严重，皮损不严重的可以考虑封闭治疗。如果皮损较严重，仍以洗剂结合皮肤科药膏局部治疗，必要时口服抗过敏药物。肛门湿疹发生的原因是透气差、湿度大或接触物不耐受或过敏所致。