通常情况下，毛囊炎与硬下疳在临床表现与病因上存在差异。具体分析如下：
1、病因差异：毛囊炎是由细菌感染引发，常见细菌包括金黄色葡萄球菌等；硬下疳是由感染梅毒螺旋体产生，是一期梅毒的典型症状表现。
2、临床表现差异：毛囊炎可能会出现在胸背部、头部、外阴部等；硬下疳多出现于外生殖器或肛门周边。
梅毒一期会出现硬下疳的症状，硬下疳以明显突出于皮肤的包块为主要临床表现，但是局部不疼不痒，在每一根毛的皮内部分都有一个毛囊，如果毛囊被金黄色葡萄球菌感染，平时一定要注意个人的卫生，多喝一些白开水，不要感冒，不要上火。
毛囊炎是生殖器部位局部的红肿凸起，有疼痛的感觉。硬下疳表面比较干净，是一种炎症渗出，它没有疼痛的感觉。硬下疳为梅毒螺旋体入侵部位发生的炎症反应，是一期梅毒的早期症状表现。毛囊炎多见于成年人，好发于头部、项部、臀部、肛周或身体其他部位，常多处发生。
毛囊炎是皮肤科常见的皮肤细菌感染，皮肤红肿，疼痛明显，而硬下疳是一种性传播疾病，最常见的表现是无痛性溃疡，应该是毛囊炎，可以吃些消炎之类的药片，平时多喝热水，吃点清淡的食物。
硬下疳是梅毒的一期损害，初起为丘疹，但很快会溃破，为圆形、边界清楚且稍高出于皮面的溃疡，上有少量渗出物，触摸时有软骨样硬度，无疼痛及压痛，皮损数目通常仅一个，表面清洁，不经治疗可在3到8周内消，不留痕迹。毛囊炎初起为红色丘疹，迅速发展成为脓疱性丘疹，四周红晕明显，继而干燥结痂，皮损数目较多，自觉有疼痛及压痛。
硬下疳属于性传播疾病，最主要表现为无痛性溃疡。毛囊炎属于皮肤科常见的皮肤细菌感染，皮损红肿、疼痛明显，应去皮肤科检查确诊后治疗。毛囊炎是整个毛囊细菌感染发生化脓性炎症。初起为红色丘疹，逐渐演变成丘疹性脓疱，孤立散在，自觉轻度疼痛，在成人主要发生于多毛的部位。