梗阻性心肌病药物治疗包括β受体阻滞剂，非二氢吡啶类钙拮抗剂等。
心力衰竭发生后，其处理原则同其它原因所致心力衰竭一样，用药有血管紧张素转换酶抑制剂（ACE），血管紧张素2受体拮抗剂（ACE-2），利尿剂（LD），螺内酯（RL）及地高辛。合并房颤时需控制心室率及抗凝治疗。在非药物治疗中主要有：
1、手术治疗中，若静息或者活动中流出道压力接差超过50mmHg则需考虑世室间隔切除术。
2、酒精室间隔消融术通过冠状动脉间隔支灌注无水酒精使此供血区域的室间隔坏死而缓解临床症状。
3、起搏治疗中，可选用右心室尖起搏以缓解左心室流出道梗阻。猝死风险高时，可考虑植入ICD治疗。
梗阻性肥厚型心肌病主要是药物治疗。
梗阻性肥厚性心肌病是肥厚性心肌病类型之一，表现在静息下左心室流出道和主动脉峰值压力阶差超过或等于30毫米汞柱的梗阻性。目前对该病的病因及发病机制尚未完全清楚。它的治疗指南建议应用β受体阻滞剂以减少血流，减轻流出道梗阻的压力。在临床工作中，β受体阻滞药常被用于高血压和心力衰竭等疾病。如果对β受体阻滞剂不能耐受或存在禁忌症者，可考虑服用维拉帕米等钙离子拮抗剂来改善症状。对无明显心律紊乱者，可选用非选择性血管紧张素转换酶抑制剂如卡维地洛。但对压力阶差的严重增大，或伴重度心衰，窦缓者慎用维拉帕米，亦可考虑手术治疗。对心功能不全患者来说，需要同时应用其他抗心力衰竭药物才能有效地控制心脏功能。
需要注意的是，具体用药应在专业医师的指导下进行。
一般情况下，非阻塞性肥胖型心肌病多是没有任何临床表现的，由于肥胖性心肌病是导致年轻人猝死的重要因素，所以要尽量做到劳逸结合，生活中要注意调节自己的心情，不要过于兴奋，如果病人有心悸、疲劳、心前区疼痛等情况，可以服用美托洛尔片、普萘洛尔片等，如果效果不好，可以服用维拉帕米片、地尔硫酸片，有较好的治疗效果，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
对于没有明显的临床表现，没有明显的临床表现是可以不必进行治疗的，这是由于病人的生命中没有明显的表现。若病人有临床表现，并有可能是因此病所致，可以服用美托洛尔，服用美托洛尔片；若病人的病情没有好转，可以转而使用维拉帕米。同时伴有心脏功能不全的病人也可以使用呋塞米片利尿；同时出现心律不齐的情况下，可以口服氨碘酮来提高心率。
一般情况下，梗阻型肥厚性心肌病可以进行药物治疗、手术治疗等。具体分析如下：
可以口服美托洛尔等药物，缓解左心室流出道阻塞，心衰、心律失常等药物，药物治疗无效，心功能不全，流出道阻塞时，可以采取外科治疗，缓解阻塞，这是当前最好的治疗方法，也可以考虑采用乙醇室间消融，但其远期疗效不明确，要谨慎。药物治疗不佳，也不能做外科治疗的，可以行起搏器治疗。