通常情况下，月经来时会头痛可能是月经期偏头痛导致的。具体分析如下：
患者在月经期间出现头痛，有时还伴有恶心，呕吐，腹泻等交感神经症状，这种情况临床上考虑以偏头痛为主，诊断称为月经期偏头痛。偏头痛是原发性头痛的一种类型，目前原因不清楚。患者月经期偏头痛，目前考虑可能与月经期间激素水平发生变化有关，部分患者月经相关性偏头痛，可有家族遗传史，也就是患者的母亲或者外婆有类似的发作史。月经相关性偏头痛，目前的治疗以对症治疗为主，可采用口服止痛药物，或针灸按摩等方法进行处理。
一般情况下，来月经会头痛是前列腺激素导致的，具体分析如下：
女性在来月经期间会有头疼的症状，这是由于女性的子宫内膜在来潮后会分泌一定数量的前列腺激素，这种激素可以收缩血管，如果有些人对于这种激素非常的敏感，那么就会产生头部的静脉微微的紧缩，从而引发头疼。通常在经期第二日或第二日过后，疼痛会有所缓解。此外，女性在来月经期间也会有头疼症状，需要到正规的医疗机构进行相关的体检，以确定是否有脑组织器官的疾病。
月经来时头痛可能是感冒、偏头痛、神经性头痛等原因引起的。在月经来临的时候，身体素质会下降，如果不注意保暖，容易受凉引起感冒，从而导致头痛；此外如果在月经期间出现偏头痛、神经性头痛等，也会引起头痛。建议患者及时就医，在医生指导下对症治疗。同时要注意休息，不能熬夜，不要过度劳累。也要注意饮食规律，饮食以清淡、易消化的食物为主。
月经来时头痛是因为月经期雌激素的水平会明显降低，而当雌激素水平降低到一定程度就会引发头痛。头痛症状轻微时则不需要治疗。如果头痛比较严重，可通过口服药物来治疗。
女性在来月经的期间，如果引发头疼症状，多数是内分泌失调导致，也有可能是情绪焦虑导致，由于少部分病人是失血严重引发贫血导致，所以在这个期间都应该养好气血，保持良好的情绪，多休息，这样都可以帮助缓解头疼。
月经期间头疼多是认为由于经期前后激素的波动，血清中雌二醇浓度降低，从而引起血管张力的变化而发生的头痛。此外，由于睡眠不足、情绪不稳定、劳累等因素引起女性内分泌功能紊乱也可导致头痛。