甲状腺萎缩一般是要长期的口服药物才可以。治疗上需终生服用甲状腺素，自己要能按时服药，定期复查甲功，根据甲功情况调整用药，平时避免吃可导致甲状腺萎缩的食物。
甲状腺细胞不能再生，所以甲状腺萎缩也无法痊愈。
甲状腺萎缩最常见的原因是自身免疫损伤所致，因为慢性淋巴细胞性甲状腺炎被归为萎缩性甲状腺结节，即由于免疫损伤，大量淋巴细胞浸润后，甲状腺细胞被破坏，随着时间的推移，甲状腺细胞慢慢死亡萎缩，导致整个甲状腺明显萎缩。疾病到这个程度后，甲状腺萎缩是不可逆的，完全不可恢复。而且在检查甲状腺功能时，会发现患者会有甲状腺功能减退的临床表现和实验室检查的特点。患者目前仍在口服药物进行替代治疗，使甲状腺功能恢复正常，但甲状腺萎缩的情况无法改善，即属于永久性改变。
这是可以恢复正常的，临床上治疗的方法主要是吃一些药物，如果想要加快疾病的恢复，可以试一下中西医结合的方法来治疗，配合针灸和汤药的治疗方法，坚持治疗以后就是可以恢复正常的。
甲状腺萎缩的原因可以是萎缩性甲状腺炎。
部分患者体内存在抑制甲状腺细胞生长的免疫球蛋白，可能是甲状腺发育不良、部分发育不良或完全发育不良，甲状腺经碘131放疗后发生甲状腺萎缩。彩色多普勒提示甲状腺萎缩，应检查甲状腺功能。患者甲状腺功能维持在正常范围内，需密切随访，出现甲状腺激素减少，需替代治疗左甲状腺激素片。
甲状腺萎缩还能治，引起的这种萎缩的情况。要到专业的内分泌科检查甲状腺功能和彩超来做出一个明确的判断，如果甲状腺素明显下降是要进行药物补充的。治疗期间要少吃辛辣刺激性食物。
