通常情况下，巧克力囊肿和子宫腺肌症可以通过药物、手术等来治疗。具体分析如下：
巧克力囊肿是子宫内膜异位到卵巢后，内膜增生形成的囊肿，囊肿内有血瘀如同巧克力糊状。巧克力囊肿可以口服雌激素治疗，减少内膜增生，缩小囊肿，还可以在宫腔内放置节育环，释放孕激素，抑制囊肿生长。还可以通过巧囊切开引流术，彻底清除病灶。
子宫腺肌症是子宫内膜生长到了子宫的肌层，一般应用芬必得等非甾体抗炎药来缓解痛经，然后进行腺肌症病灶切除术。
术后注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常，手术后注意增加蛋白质的摄入量。蛋白质可以帮助伤口快速好，可以增加体力。选择鱼类，鱼肉比较容易消化和吸收。注意休息，禁食辛辣生冷刺激东西，适当活动，增强身体抵抗力。
巧克力囊肿主要是因为子宫内膜异位症引起的，如果卵巢内有巧克力囊肿，而且囊肿比较大，是可以考虑手术治疗的。做巧克力囊肿的切除手术再月经干净以后，选择比较正规的医院，做巧克力囊肿的切除手术，手术以后也需要定期复查。
左附件巧克力囊肿不一定要手术。附件区的巧克力囊肿，就是得了子宫内膜异位症，如果囊肿比较大，并且症状比较明显，也就是痛经，需要做手术治疗。如果囊肿不是很大，症状也不明显，没有明显的痛经，暂时可以保守治疗。
通常情况下，子宫腺肌症不用手术是很难治愈的，治愈的概率很低。
如果本身腺肌症比较轻微，且成功怀孕，可能会治愈的表现，但概率很低。对于绝大多数子宫腺肌症患者通常没办法自愈，即使是使用药物保守治疗，也很难完全彻底治愈。
子宫腺肌症，也叫子宫腺肌病，是指子宫内膜腺体及间质侵入子宫肌层，并保持周期性增生、剥脱、出血等功能性改变，引起相应症状。
子宫腺肌症的患者要注意不能吃辛辣刺激性的食物，饮食清淡，建议少喝豆浆，少吃洋葱或者花生酱，加强营养。多吃红枣、莲藕粉或者黑木耳，具有补血的功效。
右附件巧克力囊肿手术后是可以怀孕的，术后要进行调养，因为手术后女性的身体比较虚弱，在手术后一个月内应该避免性生活，不然对伤口的恢复不了，而卵巢部位此时也没有得到更好的恢复，也是不利于怀孕的。
