治疗一般有以下两个方面：内镜下治疗：一般对早期单个或者多个息肉，内镜下可以切除，息肉要完整切除，做一个病理检查，如果病检证实癌变，还有外科干预，补做手术；外科手术：对多发息肉可疑癌变，或者大肠、全结肠息肉手术治疗。手术的方式也有两种，常规开腹手术，大肠部分切除或者全结肠切除。还有就是腹腔镜手术，微创，患者术后功能恢复较快，手术过程也是腹腔镜下部分肠管切除或者全结肠切除。
有阳性家族史者应警惕本病，特别是有黏液脓血便应及时到医院诊治。发现有口唇及周围皮肤，口腔黏膜及手指特殊色素斑或色素沉着，应及时做消化道造影或纤维胃镜及结肠镜检查。发现多发性息肉局限于结肠可行手术治疗，如伴发全消化道息肉则应密切随访观察；出现大出血、肠套叠或肠息肉恶变应行病变肠段切除。
家族性结肠息肉目前研究是一种常染色体显性遗传，即本家族容易发病，外来人员不易得，综合环境基础而发病。其多数息肉均为多发腺瘤，可以产生大便性状的改变。潜在风险即为癌变。少量的可以进行结肠镜下高频电刀、电凝治疗，将较大的瘤体进行切除，可以控制症状，每半年复查一次结肠镜。若病变肠段数量较多，则需要手术加病理治疗。
家族性结肠息肉可以并发症，全结肠与直肠均可有多发性腺瘤，多数腺瘤有蒂，乳头状较少见，息肉数从100左右到数千个不等，自黄豆大小至直径数厘米，常密集排列，有时成串，其组织结构与一般腺瘤无异。可出现肠套叠、肠梗阻、大出血、失血性休克等并发症。
治疗一般有以下两个方面：内镜下治疗：一般对早期单个或者多个息肉，内镜下可以切除，息肉要完整切除，做一个病理检查，如果病检证实癌变，还有外科干预，补做手术；外科手术：对多发息肉可疑癌变，或者大肠、全结肠息肉手术治疗。手术的方式也有两种，常规开腹手术，大肠部分切除或者全结肠切除。还有就是腹腔镜手术，微创，患者术后功能恢复较快，手术过程也是腹腔镜下部分肠管切除或者全结肠切除。
结肠息肉手术后，不能吃生冷、辛辣的和刺激性的食物，需要吃少量容易消化的食物。平时，也应该注意结肠炎症，并定期和系统地及时治疗。如果有家族史，需要在平时特别注意，需要定期复查，并需要在胃肠道反应发生时及时服药。