一般来说，包皮内侧起小水泡，通常要考虑以下几个方面的问题：
1、生殖器疱疹：通常生殖器疱疹能够在两周内自愈，不过此病存在极易复发的情况，复发一般病程一周左右。
2、过敏：药物过敏、食物过敏也可能会导致包皮内侧起小水泡，另外，生殖器部位接触某种物质引起的过敏性水泡也是其中一种原因。
包皮内侧起小水泡的患者平时应该注意局部的清洁与护理，勤清洗勤换内裤，保持适当运动，比如慢跑、游泳等，早睡早起，作息规律，适量吃新鲜的水果和蔬菜，并清淡饮食，有利于身体健康。
皮肤上长了水泡似的疙瘩可能是传染性软疣，丘疹性荨麻疹以及虫咬皮炎或者其他皮肤病等。需要到医院做进一步的检查，才能明确病因，在医生的指导下合理治疗。在治疗过程中一定要注意增加营养。
可能是由于单纯疱疹病毒引起的。疱疹病毒存在于皮肤和粘膜损害的渗出液、精液、前列腺分泌液、宫颈、阴道分泌液中，可通过性接触而传染给配偶或性侣，引起生殖器疱疹。
这种症状考虑是局部的炎症感染，病人感染生殖器疱疹的可能性很大或者是过敏引起的身体功能改变，出现这种症状病人应该及时就医诊断治疗，治疗期间避免劳累、饮酒、忌性生活，需要时请使用避孕套。
可能是生殖器疱疹，生殖器疱疹是由于不洁的性接触感染了疱疹病毒引起的一种性传播疾病。如果患者有高危性行为可能性就比较大，需要患者正规医院的皮肤科进一步的检查，明确诊断。另外注意休息，勤洗澡，勤换衣物，不要有性生活。
有珍珠疹等病患的可能，珍珠疹的病因尚不明确，无明显症状，也不具有传染性，可以到医院就诊检查以明确诊断，如诊断为珍珠疹可无需特殊治疗，保持清洁卫生即可，也可考虑进行激光治疗，如有包皮过长，可进行包皮环切手术治疗。