卵巢巧克力囊肿治疗后不会影响生育。手术方式有开腹手术和经腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是最符合本病处理方法。平时注意休息，以清淡易消化饮食为主，避免辛辣刺激性食物。
还是有怀孕的可能性的，注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常，要注意自身保暖，避免感寒着凉，月经期间，禁止一切剧烈体育运动及重体力劳动。
右侧卵巢巧克力囊肿是对怀孕有影响的，卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种类型。对有生育要求的女性，采用药物治疗并定期随访检查。若症状较重，经药物治疗效果不明显，可以采用保守性手术，如腹腔镜手术，以保留正常卵巢和生育功能。如果年龄较大且无生育要求的女性，可以切除全子宫以及一侧或双侧卵巢和输卵管。
巧克力中含有糖分较高，宝宝吃了巧克力，糖附着在牙齿上，从而引发蛀牙，巧克力有兴奋中枢神经系统的作用，可使宝宝处于兴奋状态而难以入眠。巧克力含有糖、脂肪较高，蛋白质较低，宝宝如果在饭前吃巧克力，容易有饱胀感，从而影响正常食欲，且易导致消化不良长久下去。
不会影响的。巧克力囊肿是卵巢的子宫内膜异位症囊肿。每个月，随着月经来潮出血，子宫内膜出血，在卵巢内部形成巧克力液体，每个月随着月经来潮增大，为了防止破裂必须手术剥离囊肿穿刺。但是手术也不能治疗好。只要月经正常，卵巢功能正常，就会复发。
巧克力囊肿的复发几率还是非常高的。在临床上，如果巧克力囊肿的病人术后没有给予相应的干预，绝大多数都会出现复发的情况。主要是因为巧克力囊肿由具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢，才引起的这种囊肿，手术很难把这种活性细胞完全根除掉，所以就会复发。