肛周脓肿属于肛周软组织的一种急性感染，多继发于肛腺的反复感染所导致的，会形成明显的脓腔，所以说最主要的治疗手段是手术进行切开引流。并且需要开放脓腔，因为如果缝合之后会导致脓腔的闭合，所以说也容易再发，甚至容易形成肛瘘，并且在手术以后还要定期进行换药，目的是让脓腔能够逐渐的愈合。也要进行系统的抗感染治疗。这就是肛周脓肿为什么医生不建议手术的原因。
肛周脓肿可以做收缩肛门的运动，也叫提肛运动。肛周脓肿手术后头几天还是要尽量少运动，多卧床休息。这种运动对于卧床，久坐的白领，久站的劳工等都有好处，平时要注意卫生。
复查肛周脓肿去当地正规的大医院咨询后进行检查治疗。要忌辛辣刺激食物，饮食清淡避免便秘，注意肛门清洁卫生，可以便后坐浴，定期医院肛肠科消毒换药，应用消炎药膏等药物，多数需要一月余愈合。
做手术因为有麻醉是不痛的，麻醉是由麻醉师来完成的，但麻药过后会痛的，可以要点止痛片，过一个晚上主动性的疼痛会好点。如果用的是半身麻醉，做完手术后下半身会完全没有知觉，然后慢慢恢复知觉，半麻后小便会成问题。
肛周脓肿分为皮下和高位脓肿，皮下的肛周脓肿不需要挂线，如果肛周脓肿的内口超过了肛管直肠环则需要挂线治疗，因为直接切断肛管直肠环会引起大便失禁。挂线则可不切断肛直环而使脓腔愈合，同时也有引流炎性渗出物的作用。