卵巢巧克力囊肿又名卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变。其症状主要是痛经进行性加重、性交疼痛、不孕及月经失调，如要治疗还用手术治疗。日常避免高度紧张及精神刺激，要保持乐观情绪以及充足的睡眠，保证良好的生活习惯；平时饮食要清淡有营养，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜常食刺激性食物、海产品等。
由于这种疾病可以在盆腔的各个位置出现，所以手术的方式也是不尽相同的，正常如果是开腹手术，费用可能会比较低，大约在10000元左右。如果是使用宫腔镜手术，费用可能会在15000元左右。另外，术后常规应该使用药物，防止双侧卵巢巧克力囊肿复发，这种药物使用3-6个月，价格也是比较高的。
卵巢巧克力囊肿危害还是非常大的：1、导致水肿，影响生活：卵巢囊肿者除了能感觉到食欲不良、体重减轻和腹部肿胀之外，还可能引起呕吐、发烧和腹部剧痛；后期甚至会导致腹部与四肢发生水肿。2、引发流产、难产：早孕时引起流产，中期妊娠时易导致卵巢蒂扭转，晚期妊娠时囊肿较大者会造成胎位异常，引起难产。
巧克力囊肿严重，造成女性月经不正常，出现月经不调的症状，还有些女性还会出现腹痛、性交痛等症状，都会给女性造成很大影响，因为巧克力囊肿引起囊肿的破裂，就会使得盆腔内积血，造成剧烈的腹痛。
如果已经怀孕了，密切关注孕酮变化及巧囊大小变化；妊娠也是对巧囊的一种治疗和控制。巧克力卵巢囊肿治疗方法主要采用药物和手术治疗。药物治疗包括：假孕疗法，假绝经疗法等，但只能缓解症状控制发展，停药后，即复发，故对卵巢巧克力囊肿多主张手术治疗，手术治疗包括腹腔镜手术和开腹手术，可行囊肿剥离术加卵巢成形术，不需要生育的，行半保守手术，即全子宫切除加患侧附件切除术。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，小的巧克力囊肿一般对身体没有什么影响，巧克力囊肿比较大容易造成卵巢、子宫病变，导致痛经，甚至引起不孕等。所以如果巧克力囊肿大于五厘米需要及时手术治疗，预防破裂或者扭转的情况。