这两种药物治疗的病症是不同的。前一个药物主要是针对病毒感染引起的妇科疾病，而另一个药物主要是治疗霉菌性的阴道炎。这两个药物是可以同时使用的，没有相互作用，不用担心，需要注意休息，增强机体的抵抗力，平时需要注意复查。
保妇康栓是一种中成药，通常不是干扰素。
临床上保妇康栓主要是一种抗炎杀菌的中成药物，对阴道炎、宫颈炎、盆腔炎等妇科炎症性疾有较好的治疗效果。如果临床上出现了上述疾病的症状，一般可以在医生指导下使用保妇康栓塞入阴道进行治疗。而干扰素主要具有抗病毒的作用，如果患者目前有HPV病毒感染，可以使用干扰素进行治疗，如重组人干扰素α2b栓。
保妇康栓和干扰素凝胶有区别。保妇康栓和干扰素凝胶治疗的病原菌不同。保妇康栓是治疗老年性阴道炎、霉菌性阴道炎以及宫颈糜烂的药物。干扰素凝胶是抗病毒的药物，主如果是宫颈糜烂伴有HPV感染，是可以应用干扰素及保妇康栓交替治疗。
HPV属于人类乳头瘤病毒感染，有可能诱发宫颈癌变的，但是目前也没有什么特效药物可以根除，一般是采取干扰素等药物阴道塞药治疗，抑制病毒增值。保妇康栓有清热解毒，去腐生肌等作用，一般用于宫颈炎症，阴道炎等。可以配合使用治疗。先遵抑制治疗观察，暂时避免性生活，遵医嘱复查。注意平时卫生，避免不洁性行为。
保妇康栓剂是一种中药制剂，干扰素栓剂是一种西药的制剂。这两种药物在用于治疗阴道炎症和HPV感染的时候，需要交替使用，是不能够同时阴道给药的。在用药之前，用相应的冲洗药物，冲洗阴道内部，在用药期间应该避免同房，并且要定期去医院做复查，根据复查的情况来调理药物。
一般情况下，“保妇康栓”需要塞入阴道10cm，具体分析如下：
最好是在睡前将其塞入阴道内的后穹隆处，因为药物进入阴道后并不会立刻溶解，而在白天将其塞入阴道内，则会引起阴道内的药力流失，从而无法有效地治愈，因此，在临睡前先将外阴冲洗一下，然后在床上将其插入阴道内，大约10cm，在阴道分泌液的帮助下，随着温度的升高，药液就会溶解，扩散到阴道内，从而达到消毒的效果。另外，在服药的时候要注意保持外阴部位的干净，避免同房，否则会影响药物的效果，也会导致新的病菌滋生。