巨趾畸形的治疗方法有很多，具体分析如下：
一、手术治疗
1、软组织切除：只有在静止状态下才能进行软组织切除，而对于更大的手指，单纯的软组织切除并不能起到减少其体积的作用，只能是暂时的缩小，大部分都要重新进行手术。同时，在单纯的软组织切除手术中，仍然存在组织肥大、外观丑陋、功能不全等问题。所以，在临床上，仅应用于单纯的软组织切除手术是非常少见。
2.骨骺阻滞术：骨骺阻滞术适用于进展型巨趾畸形，为手术破坏或切除巨趾的骨骺，以阻止骨的纵向生长，临床上此种方法采用较多。
通常来说，巨趾畸形是神经支配异常、血供异常、体液系统异常等原因引起的。
目前尚不明确的致病原因，未见显著的基因因子，且对基因的分析也未见阳性结果。部分学者认为这是由于在胚胎发育过程中，部分抑制因素对其产生的影响导致的，目前已有研究表明，神经支配异常、血供异常、体液系统异常可能是诱发因素。但如果出现这种情况，建议患者积极去医院检查，然后在医生的指导下进行对症治疗。
小头畸形要做头围测量、B超检查等检查。
1、头围测量：在患儿出生后，要进行身体数据的测量，包括身长、体重、头围等，而如果患儿的头围发育较慢，可能会是小头畸形。
2、B超检查：确认怀孕后，通常需要进行B超检查，观察胎儿发育状况，并丈量头、臀的长度，如果存在头部畸形，可能是小头畸形导致的，建议根据医生的建议选择是否继续妊娠。
短腰畸形要做体格检查、X光片、CT检查等检查。具体内容如下：
1、体格检查：患者可以在正规医院由医生进行体格检查，根据患者的体格，可以看到患者的腰短。
2、X光片：X光片检查需要前后两张平片，最理想的是左右两斜位的检查。X线片能反映脊柱的异常。
3、CT检查:有明确的疼痛和四肢乏力的表现，可以做CT扫描来确定脊髓有没有被压迫。
半椎体畸形通常要做X线检查、磁共振成像、产前彩超、三维CT、体格检查等检查，具体分析如下：
1、X线检查：通过正位X线片检查，可以观察到是否存在半椎体畸形。
2、磁共振成像：通过磁共振成像检查，在成角的椎板之间常出现自发性骨性融合，在成角的椎体间隙的后缘，常可见到椎间盘突出造成椎管狭窄，可以观察到是否存在半椎体畸形。
3、产前彩超：通过产前彩超检查，可以早期发现、排查半椎体畸形。
4、三维CT：通过三维CT检查，超可以明确X线无法显示的椎体细节。
5、体格检查：通过视诊、触诊能初步判断畸形的程度。
小儿两性畸形要做性腺和外阴检查、染色体核型检查、B超检查等检查。
1.性腺和外阴检查：能够观察性腺和外阴的发育情况，以及阴道口和尿道口的情况，能够判断是否存在两性畸形。
2.染色体核型检查：一般是用外周血在细胞生长刺激因子对染色体进行观察，有助于诊断小儿两性畸形。
3.B超检查：通过B超检查可见是否有子宫及其附件，通常来说，小儿两性畸形需要做B超检查。