甲状腺穿刺的危害包括疼痛，出血，穿刺还涉及到一个问题，即甲状腺有的肿块很小，＜1cm穿刺时手摸不到肿块。这时候彩超定位下做穿刺，可以避开大血管，穿刺更准确，位置更到位。
甲状腺穿刺检查是临床常见的检查方法。
有经验的医生选择合适的穿刺针，在超声定位下，多点选择一根细针从甲状腺结节抽吸甲状腺一点的组织，病理科医生制作病理涂抹标本，显微镜下观察其组织，进行细胞学诊断，出具病理报告。甲状腺穿刺检查直接对手术比较安全，风险不大。但是，有侵袭性的检查有疼痛、出血等风险。穿刺后注意清洁卫生，避免感染伤口，不要吃生冷刺激性食物，多休息。
通常情况下，甲状腺穿刺检查是检查甲状腺结节性质的一种方法。临床医学猜疑甲状腺结节是恶性的，或是在超声检查中查验甲状腺结节形状不规律，纵横比>1、内部结构血液丰富，内部结构有钙化点，或是头颈有很大淋巴结节，考虑为不良结节，进行甲状腺结节的穿刺活检，掌握节结内的细胞是不是恶性细胞。如果是恶性细胞，考虑进一步的手术治疗；如果是良性细胞，则可以考虑观察。
甲状腺穿刺术甲状腺穿刺术用于结节性甲状腺疾病的诊断。
甲状腺穿刺常用于一些经过各种检查仍然难以确诊的甲状腺疾病，是甲状腺肿和甲状腺结节性疾病常规的检查手段，有助于认识疾病病理性质，最后明确诊断和指导治疗甲状腺穿刺就是用小针头刺入甲状腺病变部位，抽出少量组织，用显微镜观察细胞性质作出诊断。穿刺后需注意穿刺处纱布，留置24小时后取出；忌剧烈活动。
甲状腺穿刺的危害如下：
1、局部疼痛：甲状腺穿刺是一种侵袭性检查方法，穿刺可能引起受检者局部疼痛。一般随着时间的推移，伤口逐渐愈合后，疼痛症状消失。和平时肌肉注射后一样，往往不需要特殊处理。
2、局部出血：甲状腺穿刺后部分患者可能局部出血或血肿，用无菌纱布压住伤口即可。罕见出血可压迫气管引起窒息，需抢救手术治疗。穿刺后2周内避免剧烈活动，防止伤口出血。
3、伤口感染：如果穿刺后护理不当，部分甲状腺穿刺创口可能出现感染。穿刺后不要刮伤口。不要沾水、出汗等。可以在一定程度上避免伤口感染。感染伤口的患者，可按医嘱服用抗菌药物治疗。
甲状腺穿刺是甲状腺结节治疗前病理诊断的重要手段，是目前鉴别甲状腺结节良恶性最有价值的方法。
超声发现结节有恶性征象、颈部淋巴结有恶性征象或甲状腺有结节时，测定血液降钙素水平非常高、颈部有辐射暴露史、甲状腺癌病史，需医生建议患者行甲状腺细针穿刺。超声医生应用超声引导，消毒、麻醉后，超声引导下用细针准确定位患者，穿刺甲状腺结节，抽吸甲状腺细胞，涂片后送病理科对患者进行病理诊断。