可能与遗传、环境以及性激素，以及免疫等的多种因素有关。那单纯说基因的话，红斑狼疮它不是一个单一的基因的遗传病，而是一种多种遗传相关的一个多基因病。还可以与免疫紊乱有关，比如出现一些抗体的阳性，还有就是细菌或者病毒感染，出现了体内环境的变化，造成免疫调节功能的异常而出现红斑狼疮。
系统性红斑狼疮不会自愈，因为红斑狼疮根据病情严重程度分为轻、中、重三种。对于有些轻症的人，可能只有皮肤的红斑、关节疼痛等症状，经过治疗后病情缓解，症状消失，给人一种自愈的误解，这种装况要到医院风湿科就诊，定期的随诊，监测狼疮的病情活动。当病情再次活动时可以及时发现，及时治疗，避免出现重要的脏器损伤，比如肾脏、神经系统、肺脏等。
红斑狼疮是一种慢性疾病，治疗过程较缓慢，患者可以在医生指导下应用非甾体类抗炎药，糖皮质激素和免疫制剂药物。避免日晒，对光敏感者外出要穿长袖衣服。避免着凉、感冒和其他感染，在饮食方面，要多吃高蛋白、有营养的食物，如牛奶、鸡蛋等。尽量不要吃如香菜，芹菜羊肉等发物。生活要有规律，保证充足睡眠，避免熬夜和过度劳累，可以适当锻炼，增强自身免疫力和抵抗力。
现有的科学研究支持红斑狼疮是一个环境和遗传共同作用的疾病。遗传在红斑狼疮当中也发挥着一定的作用，环境因素的影响，在遗传的背景下，如果受到环境因素刺激的话，也可能导致红斑狼疮的发病。还有就是激素的影响，男女的比例可以达到1:8-1:10，说明雌激素在红斑狼疮的发病当中发挥着非常重要的作用，所以红斑狼疮在一些育龄期或者妊娠期女性发病率是明显增加的。
红斑狼疮是一种自身性免疫疾病，是由于体内中性粒细胞脱颗粒所造成的体内感染，有80%的控制良好，但是如果有系统性红斑狼疮，且发现较晚、不配合的话，很容易造成胸腔内脏器的损伤，十年的存活率可以达90%，更严重者，甚至只能存活5到6年左右。
红斑狼疮的治疗目前还是以西医为主。红斑狼疮是风湿免疫系统疾病里面一个比较常见的类型，主要是多以多器官多系统受损为主要表现，它可以累积到皮肤，血液系统以及肾脏等多个脏器。中药单纯应用对狼疮没有什么太大的作用，但是可以作为西药的辅助治疗，比如可以吃点百令胶囊来辅助提高、调节免疫功能。