病毒性肠炎没有特效的治疗方法，对于轻、中度脱水的采取补液纠正水电解质紊乱，应用抗病毒药物，同时可以用中药灌肠治疗，饮食要选用易消化的食品，因为消化吸收功能差，应选用易消化半流少渣饮食，少量多餐，以增加营养。
有明显的腹泻现象，是由于轮状病毒感染所导致的秋季腹泻现象。是需要及时去医院进行输液治疗的，同时还需要通过使用抗病毒药物和补脾收敛的药物，达到至于这种病毒感染而导致肠炎的症状。
大便无或者是偶见少量的白细胞，多为侵袭性细菌以外的因素，如病毒非侵袭性细菌，肠道寄生虫感染，喂养不当引起的腹泻多呈水样，有时伴有脱水症状，可以出现过敏的表现。
若婴儿患上可病毒性肠炎，应采取下列措施：
第一，要注意饮食的调整。可以让婴儿多食用清淡的食物，从少量到大量，从稀薄到粘稠。
第二，是调整肠道菌类的方法。给孩子喂，双歧杆菌，三联活菌，蜡样芽胞杆菌，以及其他一些药物。
第三，保护胃肠道的正常组织。可以口服蒙脱石散、蒙脱石混悬液等药物。
第四、给婴儿吃一些锌制剂，例如：赖氨酸补锌颗粒、葡萄糖酸锌、赖氨酸补锌颗粒，有助于改善婴儿的消化功能。
如果得了病毒性肠炎首先需要抗病毒治疗清淡饮食，避免食寒凉生冷辛辣刺激油腻的食物，注意腹部保暖，现在拉蛋花样的便便，是已经有好转，平常，也是要做好个人卫生护理，注意好休息和饮食，这个期间还是不要盲目使用任何药物的。
小儿病毒性肠炎一般很容易治疗，但是治疗的难度要看病情和小儿自身体质。
如果小儿病毒性肠炎病情较轻，体质较好，抵抗力较强，经过适当的治疗，如饮食调理，抗病毒治疗，服用利巴韦林等，一周左右即可痊愈。
如果小儿病毒性肠炎病情比较严重，身体素质较差，抵抗力较弱，或者治疗不当，导致严重腹泻，导致体内水电解质平衡紊乱。可以使用利巴韦林进行抗病毒治疗，配合蒙脱石散止泻，使用枯草杆菌二联活菌颗粒调节肠道的正常菌群，一般情况下都能很快痊愈。