超声介入治疗对于身体的危害不大，还会比开腹手术创伤面小，不过不论是超声介入手术还是，开腹手术，都不能完全避免病情的复发。做完手术后要注重一些饮食，荤素搭配，饮食多样化。多吃新鲜的蔬菜和水果忌辛辣刺激性的食物。
可以做超声介入治疗的，卵巢右侧巧克力囊肿比较大，可能会压迫周围的组织，还会引起月经失调，痛经等疾病，也可以做个腹腔镜手术治疗合适，手术后做个活检，需要排除恶性肿瘤的发生。
巧克力囊肿的治疗方法是超声下介入治疗，子宫内膜异位到盆腔，80%在卵巢上种植，因内膜组织与卵巢有亲和力，每月月经来潮时在异位内膜区域可形成出血，周围组织对其包裹而形成囊肿，内存陈旧性血液，呈巧克力色，故名巧克力囊肿。
超声介入治疗巧克力囊肿效果好。囊肿超声介入治疗是经皮穿刺抽吸囊液联合硬化剂硬化治疗，属于手术范围，在超声影像引导及监测下，利用直径约1.1mm的金属针，准确穿刺到囊腔内，穿刺过程全时监测，穿刺路径为经腹部或者经阴道，取决于病人是否已婚、囊肿位置高低以及穿刺路径障碍大小等因素。
在月经期间进行手术，会导致出血的增多，在手术的时候不可避免造成组织的创伤，使大量的凝血因子激活并消耗，在这期间进行手术术中的创面渗血较多，影响手术的操作，术后渗血较多，会引起气道的受压等继发性的问题。
巧克力囊肿能做手术。确诊后宜立即手术，因流出的囊液可引起盆腔粘连，引起不育或异位内膜的再次播散和种植。年轻未生育者在吸引和彻底冲洗吸引溢入盆腔内的囊液后，做囊肿剥出术，尽量保存正常卵巢组织，对维持卵巢功能和内分泌功能有助，对日后增加孕育机会也有助，对年龄较大且已有子女对侧卵巢正常、子宫无受累者为避免日后复发，也可考虑作患侧附件切除。