临床上首先表现为口痛，厌食及低热，亦可不发热。口腔内可见散在性小疱疹或溃疡，位于舌、颊粘膜及硬腭等处为多。皮疹可先见斑丘疹，后转为疱疹。皮疹出现于手脚为多，掌背均有，也可见于臂，腿及臀部。少数见于躯干四肢和口周，皮疹通常不痒不痛，病程较短，多于一周左右痊愈，皮疹不留瘢痕或色素沉着，须防止继发感染，少部分可发生中枢神经系统感染，心肌炎等并发症。
多数手足口病都会出现有不同程度的发热，除此之外，在口腔粘膜的位置也会出现一些疱疹，双手和双足之间都会出现有一些小的丘疹，少的几个，多的有几十个，程度比较严重的，还会伴随有嗜睡或者是精神差，食欲明显下降等表现，随着疾病程度的加重，还可能会危及到心脏等的健康。
孩子得手足口病，是由于手足口病病毒感染引起的，前期症状和普通的感冒差不多，出现发烧，流眼泪，打喷嚏，流鼻涕，有的孩子还出现流口水等，手足口病应及时带孩子去医院做检查，必要住院治疗。
手足口病的症状其实主要还是手、口腔和脚底部出现一些小水泡，有时臀部也会出现丘疹。这种小水泡它是透明的，周围有红晕，有时非常的小，主要是因为病毒感染导致，所以它的水泡和脓疱疮浑浊的水泡不一样。
手足口病初期症状其实和感冒、上呼吸道感染很相似，也和最常见的腹泻相似，早期可能会有发热、没有精神、乏力、咳嗽、打喷嚏、流鼻涕、嗓子疼等症状，还有一些孩子表现出的是消化道症状，比如食欲不振，比如恶心、呕吐或腹泻，总之都不很典型。在出现皮疹以前，可能都会误以为是腹泻或者是上呼吸道感染。