怀孕会卵巢囊肿的原因如下：
女性患者在怀孕以后，卵巢需要形成黄体，黄体的分泌的激素，才能够支撑正常的怀孕，继续延伸下去。在这情况下，卵巢的黄体继续增大，就会在B超下显示，卵巢比没有怀孕时要大，因此，孕妇对于这个问题不必过度紧张担忧。如果囊肿存在异常，就需要及时去正规医院进行检查治疗，防止出现不必要的意外。另外，孕妈在孕期需要定期去正规医院进行产检，观察胎儿的发育状况，排除胎儿的异常情况。
卵巢囊肿的病因并不是很清楚，可能有多方面的原因，有的是先天性的，有的与内分泌有关系等。另外，对于卵巢囊肿的治疗，药物治疗是没有作用，除非是手术治疗，但大多数很小的囊肿不需要治疗。不知道病人的囊肿大小，若是囊肿小于5cm，定期复查就可以。
怀孕前卵巢囊肿可能是由于体内激素的刺激，导致卵巢囊肿增大，但是怀孕初期不会出现卵巢囊肿疼痛。
怀孕初期受体内激素的刺激，只会使囊肿增大，而不会引起囊肿的破裂和扭转。如果是卵巢巧克力囊肿，怀孕后卵巢巧克力囊肿会慢慢萎缩，所以卵巢巧克力囊肿不会引起疼痛，反而会随着孕周的增加而逐渐萎缩变小，甚至有可能是怀孕后自愈。
一般手术以后，囊肿都是可能会再次复发的，由于炎性囊肿通常可以考虑进行输液来消炎止痛治疗，消炎以后囊肿会消失，如果再次复发感染炎症，囊肿就会再次复发生长，而卵巢巧克力囊肿是因为子宫内膜异位导致，所以即便切除以后也有可能会导致内膜的再次异位而复发。
生理性卵巢囊肿包括卵巢潴留囊肿、黄体妊娠囊肿。生理性囊肿一般初次发现，病程短，一般月经干净后复查彩超可以消失。病理性卵巢囊肿一般病程持续半年以上，做彩超可疑卵巢子宫内膜异位囊肿，或卵巢畸胎瘤或交界性肿瘤或卵巢癌，一般需要手术治疗。