在做产前MRI的时候，需要考虑到胎儿侧脑室增宽，有没有钙化灶，有没有软化灶，有没有脑出血，有脑血管异常，也有可能是头部太大，也可能是头部太大。经核磁共振对胎儿头部进行诊断，以确定是否存在头部器官损害。怀孕22-26周时进行B超检查，发现有可能是胎儿的头部有问题，建议做头颅、MRI。明确诊断后再进行相应的处理，有明显的不正常会对孩子的智商造成一定的损害，建议进行引产手术来结束怀孕。
脑部核磁共振不能查脑供血不足，可以通过脑部核磁共振观察颅内血管走形及各级分支，观察血管有无畸形，有无狭窄，闭塞等。脑供血不足，需做个脑血管造影才能明确的。
在早产儿出生后和两岁时对他们进行核磁共振，可以了解婴儿脑白质状况。科学家通过核磁共振技术，定期扫描婴儿脑部的图像，并且将这些图像进行对比。就能发现早产儿是否有脑白质的损伤，如果没有就能确定婴儿的大脑发育基本正常，而如果脑白质发生了损伤，那么早产儿脑很可能会出现脑瘫、认知延迟以及视觉或听觉障碍等脑部疾病。
磁共振可以检查肺，对神经系统、骨骼肌肉运动系统和肝胆等诊断效果非常好，但是对呼吸系统和肠道的诊断效果差，磁共振完全可以检查出各系统的肿瘤问题，只对于不同的组织器官敏感度和准确性有差异。
可以检查脑实质，侧脑室，中线结构，鞍区，双侧乳突，双侧眼球及眼眶，以及部分鼻窦和鼻咽。磁共振在临床上的应用非常广泛。磁共振检查头部，对于头部所存在的绝大部分问题都可以查出来，磁共振对软组织的检查更具优势。
颈椎磁共振能检查出颈椎间盘突出和颈椎管狭窄。颈椎的核磁共振检查结果如下：
第一，颈椎间盘突出和颈椎管狭窄：颈椎病、颈椎间盘突出、颈椎病、颈椎间盘突出，颈椎核磁检查是可以明确诊断的。
第二，颈脊髓损伤：颈段脊髓的神经病变，如缺血、缺氧、坏死、软化等，都能通过MRI进行明确诊断。
大部分的颈椎病变都是由MRI表现出来的，但CT只是一个横截面，或者是一个平面，没有MRI那么清楚。
