脑积水手术治疗最佳时机是立即进行治疗。
脑积水是脑室内脑脊液的分泌，无法被充分的吸收引起的，可能会对周围脑组织、脑实质造成压力，造成脑组织、脑实质的损伤，还可能造成脑功能的异常，甚至有可能出现昏迷致死的情况。因此，如果出现脑积水，要马上进行手术，如果是急性脑水肿，必须马上住院做脑室检查，并放出脑脊液以确保患者的生命。一些儿童在发病初期1~3月就可以进行长期的脑脊液干预治疗，经过规范的处理，对儿童的大脑的组织和脑功能没有任何的影响，可以得到有效的治疗。
脑积水的手术成功率比较高，手术后能够显着减轻病人颅内压偏高和脑室扩大的情况。
临床上需根据病人病因来判断手术治疗成功率，由于有些病人病因属颅内肿瘤且在肿瘤切除前病人症状并无明显减轻，若病人属梗塞性脑积水则在分流手术后需长时间复查及追踪才能使脑积水的症状得到长时间的控制或者减轻。
一般需重视手术时机的选择，如在脑积水的症状初期实施手术则效果更佳，如在症状晚期实施手术则因病人已存在明显的神经功能丧失，手术虽能成功但效果不佳。
脑积水手术后2周-3周可以恢复。脑积水的主要表现为脑室扩大，病人可能会有头痛，头晕，恶心呕吐等颅内高压的表现，常见到的是慢性脑积水通过脑室腹腔分流的方式进行手术治疗。
脑积水手术风险并不大，脑积水手术创伤是很小的，属于微创手术，脑积水分为梗阻性脑积水和交通性脑积水，这两者的手术方式不一样，梗阻性脑积水通过三脑室底造瘘手术的方式治疗，而交通性脑积水通过脑室腹腔分流手术的方式治疗，这两者都创伤不大，也风险不大，所以有脑积水需要积极的治疗。
但是严重的脑积水，甚至出现昏迷瘫痪等症状的患者，生存的时间就非常短，甚至不到一个月。导致脑积水的原因是比较多的，最为常见的就是颅内感染，比如脑膜炎，化脓性脑炎等，这些疾病都会引起脑水肿的现象，在出现脑水肿现象的时候，应当尽早的进行手术分流治疗。
通常情况下，儿童脑积水的手术主要采用脑脊液分流术，费用在4-7万之间。
如果做一次性分流术的话，分流管是主要治疗费用，就强生分流管来说，可调压型大约需要4万，再加治疗费用和手术费共需要6万～7万。蛇牌分流管价格比较高。但是一次性分流术中，容易出现术后感染和分流管阻塞等危险，因此临床上提出可以先行引流，在脑脊液到达正常范围时再行二次分流，手术成功率较高。