注射乙肝疫苗后通常会产生抗体。
一般来说，注射乙肝疫苗后，大多数人都会产生乙肝抗体，但还是有少部分人会产生抗体，这可能与身体对乙肝疫苗的反应弱有关，或者本身就感染了乙肝病毒。乙肝病毒携带者表面抗原呈阴性。乙肝病毒携带者打疫苗时不会产生抗体，所以要定期检测乙肝病毒DNA。如果病毒呈阴性，可以考虑打加强针加强乙肝疫苗的刺激，看是否会产生表面抗体。
注射乙肝疫苗后，人体免疫系统会对疫苗中的蛋白质抗原产生反应，一般在注射疫苗后大约一个月左右就会产生抗体，刚开始抗体水平很低，到了第二针，抗体水平就会迅速上升，很快就能抵抗乙肝病毒感染。接种乙肝疫苗后，从理论分析半个月后会逐渐产生抗体。不过早期抗体的浓度比较低，接种三针结束后，90%以上的患者都会出现保护性抗体。
接种乙肝疫苗是为了预防感染乙型肝炎病毒，目前接种乙肝疫苗方案就是第一次打了第一针，之后一个月的时候打第二针，第六个月的时候打第三针，前面两针主要是产生抗体，第三针主要是加强抗体的，在打完第三针之后过两个月也就是第八个月的时候可以做乙肝两对半检查化验看有没有抗体。
乙肝疫苗在注射第一针后，30%的人产生表面抗体，第二针后50到70%的人产生表面抗体，第三针90%的人产生表面抗体。在全程注射完乙肝疫苗一个月后，应再次检测乙肝表面抗体产生抗体。
乙肝疫苗打一针产生抗体定量大于100至少可以持续5年-7年，抗体的水平越高，持续的时间越长，就算抗体水平下降，也能起到很好的保护作用的，因为乙肝的免疫是有记忆的功能的。
乙型肝炎疫苗效价过低，检测方法不精确，实际上机体已产生抗体，但因检测方法不精确而致结果呈现阴性，免疫应答太弱，机体对疫苗的免疫应答太弱，只产生微量抗体，以至于用先进的检测方法仍未能发现抗-HBs的踪迹，已发生隐匿性感染，有晚期肾病、器官移植后、HIV感染者等类似情况的人不易产生抗体。