核磁共振是通过磁场运动产生所信号来表现正常组织或病变性质。磁共振的序列较多，主要是T1、T2、DWI等以及在此基础上产生的某些特殊序列。大部分病T1都是低信号，出现了T1高信号，病灶性质可能是脂肪、出血、粘液、蛋白。T2大部分是高信号，出现低信号可能是钙化或者气体。DWI出现高信号最常见的是脑梗塞。
核磁共振和ct，ct辐射大。磁共振是人体细胞内的氢原子核在强大的磁场空间内，产生共振运动，经过一系列重建技术转换成磁共振图像用于临床诊断，所以磁共振是没有电离辐射的。而CT却是利用X线成像原理形成图像的，所以CT是有X线电离辐射的。
一般情况下，小孩做脑CT和核磁共振有一定伤害，但是伤害较小。
小孩做脑CT，通常有一定的辐射损小孩的全身影响是比较小的，因为一次脑CT受到的辐射量通常是有限的，只要不是多次进行，一般不会造成较大的伤害。而核磁共振对于孩子的伤害则相对更小，因为核磁共振的成像一般和射线没有较为明显的关系，因次，也不会对小孩造成较为明显的辐射性损伤。
怀孕期间可以进行核磁共振检查，因为孕妇有肥胖、羊水不足、胎儿已经进入盆内，或者是产前超声无法确认的情况。
可以为胎儿胃肠道和消化道的异常情况提供更多的补充资料。建议孕妇和家人不要害怕核磁共振会产生辐射，也不要担心会对胎儿的发育有什么影响。在怀孕的3个月内，胎儿正处在细胞的分化发育阶段，因此要避免做核磁共振。
核磁共振之下的膝关节，从上到下分别可以看到，股外侧肌，股二头肌，外侧半月板，胫骨外侧踝，腓骨，胫骨前肌，腓肠肌外侧头，趾长伸肌等，可以通过核磁共振在计算机显示的图像，观察膝盖骨骼结构是否完整或是否发生变形，来判断膝盖的受伤程度。
一般情况下，核磁共振是神经外科最常用的技术之一，应用于大脑病变患者，甚至是癫痫症患者。MRI可以检测到脑部的组织是否有任何的问题，比如肿瘤、出血、创伤、脑组织的畸形等。而且，清晰度更高，甚至可以通过谐波检测，观察到微小的损伤。CT会产生一些放射性物质，对于一些孕妇和即将受孕的女性来说，最好不要接触。而核磁共振成像则比较无放射性，因而更为保险。
