采用局部治疗，同时结合全身的治疗，延长间歇期，缩短发作期，缓解疼痛。局部治疗以消炎止痛为主，促进愈合防止继发感染。局部可以使用消炎类药物进行治疗。对于经久不愈或者严重疼痛的溃疡，也可以进行粘膜下封闭注射。
反复口腔溃疡，通常2周自愈，局部可用止痛类药物，进行消炎、止痛，促进溃疡愈合。其次是自身免疫性疾病引起的口腔溃疡，可以采取免疫抑制剂，同时口服维生素，从而维持正常代谢功能，促进疾病愈合。
预防口腔溃疡的主要的方法是科学的因素和多吃蔬果等，适当的补充维生素，才能避免复发的，平时少吃上火的东西，建议平时避免粗糙过烫食物对黏膜的刺激，营养均衡，饮食清淡，保持有规律的进餐习惯。
首先要控制口腔的感染，经常会有病毒性或细菌性的感染造成口腔溃疡，要给予抗病毒或抗菌类的药物进行治疗。同时还可以配合具有消炎作用的喷剂，来进行局部消炎治疗，从而促进溃疡的恢复。
出现口腔溃疡需要补充维生素。口腔溃疡可能是精神因素导致的口腔溃疡、病毒感染造成的口腔溃疡需要是抗病毒治疗，创伤造成的口腔溃疡，烫伤造成的口腔溃疡，有针对性的进行补充。