早期肛瘘通过直肠肛门指检，可以摸到条索状的一个管道、大部分通过目测和直肠肛门指诊即可检查出来，少部分复杂或难以确诊的，做腔内超声或者是肛周超声或核磁共振进行确诊，通过直肠腔内超声，能够发现直肠肛围的脓肿、管道等。
头颅磁共振可以检查脑血管病、脑炎、脑肿瘤、脑外伤、脱髓鞘疾病、神经系统变性病等。头颅磁共振可以做血管成像，主要可用于颅内血管狭窄或闭塞、颅内动脉瘤、脑血管畸形的诊断。磁共振能显示人体任意断面的解剖结构，可以提供冠状位、矢状位和横位三维图像，清楚显示脑干小脑等后颅窝病变。
肝脏磁共振检查通常是用于肝脏内的肿块性质不明确时进行的，临床上对于肝脏内常规检查是做B超来检查的，但B超检查发现的肿块又性质不明确的，需进行磁共振检查并进行增强扫描，大致方法是通过磁共振检查后注射显影剂，观察肿块对显影剂的吸收和显影程度来判断性质。磁共振检查时不要戴金属，不要活动。
核磁共振检查是脊柱系统疾病的一种非常常见的辅助检查方式，由于对软组织以及骨骼系统均有良好的成像效果，所以，主要用于检查脊柱脊髓神经以及周围软组织的病变。磁共振对于脊柱系统疾病的检查范围非常广泛，胸椎磁共振检查主要用于胸椎结核，胸椎的骨折脱位，胸椎段脊髓神经的病变以及损伤，胸椎及胸椎周围的良恶性肿瘤、转移瘤以及胸椎周围软组织、韧带的急慢性损伤等。
TCT化验检查即使没问题的情况下也需要做HPV化验检查，因为两者是不同的。TCT是表明宫颈上皮是否存在病变的检查结果，而HPV是看宫颈上皮是否有病变的检查，所以两者要同时做检查，然后综合性的分析。
