输卵管堵塞临床上治疗的方法有输卵管通液消炎或者宫腹腔镜三镜一丝手术治疗。具体采取哪种治疗方法，需要根据堵塞程度与部位进行选择。如果输卵管通而不畅，可以月经干净后3～5天行输卵管通液消炎治疗，1-2个疗程结束后复查，效果还是比较好的。
输卵管阻塞需要去医院检查来确认的，主要检查有输卵管通液和输卵管造影检查。需查清堵塞的部位是在近端，中端还是远端，不同的病因和部位治疗的方法是不同的。建议先做检查确定具体的堵塞部位及程度，然后根据检查结果在医生指导下制定适合病人自身情况的手术方案，进行疏通。
宫腔镜检查，观察子宫腔形态、内膜的色泽和厚度、双侧输卵管开口，要进行手术。输卵管成形术：对输卵管阻塞部位可行腹腔镜下输卵管造口术、整形术、吻合术以达到输卵管再通的目的。
药物治疗，如果是轻度的输卵管堵塞，输卵管堵塞主要表现为通而不畅，考虑是炎性疾病导致的，可以选择使用抗生素，同时加用活血化瘀的中药进行治疗。在治疗的同时，可以配合腹部理疗、灌肠、宫腔注射等中医各项的适宜技术进行治疗。
输卵管堵塞的治疗有多种方法，而且有传统方法和现代方法之分。对于输卵管堵塞的治疗，传统方法采用输卵管通液进行治疗，通过美蓝液或生理盐水自宫颈注入宫腔，再从宫腔流入输卵管，原理是通过药物及通液压力疏通与治疗输卵管梗阻。
进行完手术后2周内禁止性生活和盆浴，同时应使用抗生素预防感染。之后如果同房需要注意好卫生和同房卫生，这样也是为了确保复发炎症的可能性。规律作息，少吃辛辣刺激的食物。