治疗肛门湿疹应该去当地比较正规的三甲医院接受正规的治疗。大多数的三甲医院治疗肛门湿疹的效果是一样的，只有一些不知名的小医院治疗效果会比较的差劲，因为小医院的治疗手段比较少，医疗条件也是相对十分有限。
肛门湿疹尽可能寻找病因，故需对工作环境、生活习惯、饮食、嗜好及思想情绪等作深入的了解，并对全身情况进行全面检查，有无慢性病灶及内脏器官疾病，以除去可能的致病因素。避免各种外界刺激，如热水烫洗、暴力搔抓、过度洗拭以及其他敏感的物质等。避免易致敏和有刺激的食物。
可以到国家公立医院就诊，也可以是所在地的三甲医院都可以的。肛周湿疹是一种炎症性皮肤反应，病因不明。临床表现包括瘙痒，红斑，脱屑及成群的丘疱疹。出现流脓溃烂的话要注意伤口不要感染了。
从中医方面来说，这属于湿热下注。你可以找当地的中医看看，用些清热燥湿的中药治疗，根据病情辩证加减药物。建议可以在医生指导下选择外用药物治疗较好的，注意不要吃辛辣的食物，适当的保持外阴的卫生，注意继续定期的复查。
治肛门湿疹一定要到正规的医院专科专治。忌食辛辣刺激食物，忌酒，海鲜羊肉等食物，避免劳累，注意休息，适当活动，增强免疫力。注意局部保持干爽，清洁，避免手抓，穿棉质内裤，避免湿巾擦拭。
肛门湿疹可以外用疗法，原则与接触性皮炎的治疗相同。看皮损情况选用适当剂型和药物。对小范围亚急性湿疹应用糖皮质激素霜剂，糖皮质激素的口服或注射不宜使用，激素虽对消炎、止痒及减少渗出的作用较快，但停用后很快复发，长期应用易引起许多不良反应。