切勿轻视结肠炎比较好的治疗时间，治疗越早效果越好。结肠炎的众多，而多数人都不注意结肠炎的治疗。中医认为，结肠炎是由饮食不节、精神刺激、感受四时疫情，治疗不当、迁延日久、寒湿热功当量三邪蕴结而成。病程日久、反复发作、顽固难愈、易转癌变。
直肠粘膜水肿者，可用生理盐水、鞣酸、灌洗直肠。粘膜糜烂者，可涂醋酸可的松溶液或硝酸银溶液。括约肌、肛提肌痉挛者，可将温橄榄油注入直肠内。临床上，用蜂蜜、芝麻油各50-100毫升和黄霉液50-100毫升，隔一天交替保留灌肠，每天2次，有很好的疗效。
直肠炎在初期时是治疗时间。可采用中药理气舒肠方治疗，西药治疗，中西药结合灌肠。也可以采用心理疗法。可予高营养、低脂、少渣易消化饮食，白扁豆、苡米等煮粥，常食健脾养胃。
一般情况下，直肠炎最佳治疗方法是药物治疗。具体情况分析如下：
直肠炎是一种比较常见的肠病。直肠炎患者可以通过口服、肌肉注射或静脉滴注等方式进行药物治疗，同时口服和口服药物进行调理。直肠灌洗是治疗直肠粘膜水肿的有效方法。如果是直肠粘膜糜烂，可以用硝酸可的松溶液或硝酸盐溶液来治疗。其次，从中医角度来说，可以通过理气疏肝的方式来进行肝的调理，并要注意饮食习惯。
肠炎通常会用一些方法减轻直肠黏膜水肿，口服一些药物，改变肠道的菌群，给予一些益生菌药物。医院肛肠科有些病人，采用把弥散的He-Ne激光导到直肠腔里，做黏膜照射也能够起到很好的治疗作用。
一般情况下，艾灸肛门对直肠炎的治疗，能达到辅助治疗的效果。
直肠炎多由肠道内菌群失调、有害菌滋生引起，而艾炙通常无杀菌、消炎之功效，故艾灸无法直接用于直肠炎，只能起到辅助治疗的作用。直肠炎以药物治疗为主，在平时要注意生活作息规律，尽量不吃辛辣刺激性食物，不要滥用抗生素，以免对肠道正常菌群造成损害，这样才能控制直肠炎病情。
