如果体检中查出甲状腺抗体较高，提示可能有此自身免疫性甲状腺疾病可能性。
甲状腺抗体有很多种，常见的甲状腺抗体有抗甲状腺过氧化物酶抗体、抗甲状腺球蛋白抗体等。自身免疫性甲状腺疾病其中之一就是甲亢了，其一为慢性淋巴细胞性甲状腺炎，如发生抗体较高等，一方面应该检查甲状腺功能是否正常，看是否存在功能亢进或功能减退，再次是又去做甲状腺超声了，那就看甲状腺有没有弥漫性增大，判断是不是如得了哪种有关免疫性甲状腺疾病。
甲状腺抗体高，可能是由于甲状腺功能亢进所引起，可以去医院检查一下，看是否与甲状腺功能亢进有关。如果是甲状腺功能亢进所引起，可以在饮食上要注意，要低盐饮食，不要吃过于油腻、辛辣的刺激性食物，尽量少吃海鲜，忌烟忌酒。保持乐观开朗的心情，在情绪上不要有太大的波动，可以适当的加强体育锻炼。
怀孕期间甲状腺球蛋白抗体升高，只要甲状腺功能无异常，就不需要特殊治疗。
另外，怀孕期间甲状腺球蛋白抗体的上升可能在怀孕之前上升，而不是因为怀孕以后上升，但患者并不注意。偶然怀孕后采血检查甲状腺功能，只发现甲状腺蛋白质抗体上升。合并甲状腺功能减退症，患者应接受左甲状腺激素替代治疗。如果抗体上升，只是甲状腺激素没有变化，就不需要特殊处理。甲状腺球蛋白抗体升高往往提示机体发生了自身免疫性疾病，但这种自身免疫性疾病何时发生尚不十分清楚，一般等待分娩后再进行阶段性检查。
甲状腺的两种抗体通常是指甲状腺过氧化物酶抗体和甲状腺球蛋白抗体。甲状腺两抗体高提示患者患有桥本甲状腺炎，即慢性淋巴细胞性甲状腺炎，甲状腺慢性炎症较常见，尤其容易发生在女性身上。
桥本炎容易导致甲状腺功能下降，需要定期检查甲状腺功能。如果甲状腺功能正常，不需要特殊处理，定期观察即可。甲状腺功能减退，需服用甲状腺激素治疗，日常生活中注意低碘饮食。甲状腺两抗体高代表桥本甲状腺炎，需定期检测甲状腺功能，甲状腺功能正常方可处理。如果发现甲状腺功能下降，应给予甲状腺激素替代治疗。
甲状腺抗体水平升高，具体治疗方法结合甲状腺功能：
1.甲状腺自身抗体水平升高，同时伴甲状腺功能减退，一般需激素替代治疗。
2.如果甲状腺抗体水平升高，同时甲状腺功能正常，则通常不需要治疗。
3.甲状腺抗体水平升高，同时合并甲状腺功能亢进，通常被认为很可能是Graves病，可采用药物治疗，手术治疗或碘-131治疗。
抗甲状腺过氧化物酶抗体为自身免疫损伤的标志物，也是诊断甲状腺自身免疫性疾病的首选指标。若其有所增高，则代表着体内存在自身免疫的破坏。若在升高的同时，出现促甲状腺素下降，血清游离T3、T4升高，表示合并甲亢，此时应接受抗甲亢药物治疗。